29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2617 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2617  recombination and repair protein RecT  100 
 
 
268 aa  560  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000206281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0604  recombination and repair protein RecT  65.84 
 
 
281 aa  374  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1472  recombination and repair protein RecT  47.56 
 
 
300 aa  226  3e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.515262  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1851  RecT protein  46.9 
 
 
349 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0204847  decreased coverage  0.000000000311645 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2295  RecT protein  48.08 
 
 
269 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133363  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01336  hypothetical protein  48.08 
 
 
269 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01326  recombination and repair protein  48.08 
 
 
269 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1382  recombination and repair protein RecT  43.39 
 
 
276 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000254024 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7123  RecT protein  34.9 
 
 
351 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0610415  hitchhiker  0.000150871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2507  RecT protein  39.02 
 
 
318 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5094  RecT protein  41.11 
 
 
320 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713826  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4075  RecT protein  37.91 
 
 
312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2699  rect protein  35.02 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497074  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4008  RecT protein  30.92 
 
 
299 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275216  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3047  RecT protein  33.64 
 
 
313 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00571481  normal  0.0332137 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0939  RecT family protein  32.03 
 
 
289 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1916  RecT protein  31.51 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.427469  hitchhiker  0.0000000000811142 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0283  RecT family protein  36.22 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4070  RecT protein  30.85 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0866384  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1419  phage recombinase  32.97 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000444725  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1003  RecT protein  29.27 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  hitchhiker  0.0000388428 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2078  RecT protein  29.79 
 
 
306 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0329  RecT protein  29.79 
 
 
306 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2041  RecT protein  29.79 
 
 
306 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0320  RecT protein  29.79 
 
 
306 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1674  recombinational DNA repair protein (RecE pathway)  23.55 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1139  RecT protein  27.98 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0811  RecT protein  26.83 
 
 
309 aa  56.6  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.481078  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4180  hypothetical protein  27.56 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.171725  normal  0.246945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>