19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3047 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3047  RecT protein  100 
 
 		 313 aa  645    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00571481  normal  0.0332137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4008  RecT protein  62.63 
 
 		 299 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2617  recombination and repair protein RecT  33.64 
 
 		 268 aa  102  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000206281  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2295  RecT protein  29.55 
 
 		 269 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133363  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01326  recombination and repair protein  29.55 
 
 		 269 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01336  hypothetical protein  29.55 
 
 		 269 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1472  recombination and repair protein RecT  28.94 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.515262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0604  recombination and repair protein RecT  30.09 
 
 		 281 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4070  RecT protein  33.16 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0866384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1382  recombination and repair protein RecT  30.45 
 
 		 276 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000254024 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1851  RecT protein  28.63 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0204847  decreased coverage  0.000000000311645 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7123  RecT protein  34.73 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0610415  hitchhiker  0.000150871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1916  RecT protein  34.3 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.427469  hitchhiker  0.0000000000811142 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2699  rect protein  25.32 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497074  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2507  RecT protein  26.53 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1003  RecT protein  31.21 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  hitchhiker  0.0000388428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4075  RecT protein  25.83 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5094  RecT protein  25.64 
 
 		 320 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713826  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0283  RecT family protein  23.97 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>