22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4008 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4008  RecT protein  100 
 
 		 299 aa  603  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3047  RecT protein  62.63 
 
 		 313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00571481  normal  0.0332137 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2617  recombination and repair protein RecT  30.92 
 
 		 268 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000206281  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2295  RecT protein  30.17 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133363  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01326  recombination and repair protein  30.17 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01336  hypothetical protein  30.17 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1472  recombination and repair protein RecT  31.14 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.515262  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1382  recombination and repair protein RecT  30.87 
 
 		 276 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000254024 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4070  RecT protein  31.02 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0866384  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0604  recombination and repair protein RecT  27.55 
 
 		 281 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1851  RecT protein  29.41 
 
 		 349 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0204847  decreased coverage  0.000000000311645 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7123  RecT protein  30.88 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0610415  hitchhiker  0.000150871 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2699  rect protein  27.59 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497074  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1916  RecT protein  33.53 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.427469  hitchhiker  0.0000000000811142 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1003  RecT protein  27.78 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  hitchhiker  0.0000388428 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0283  RecT family protein  26.67 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2507  RecT protein  28.57 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5094  RecT protein  26.84 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713826  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4075  RecT protein  26.58 
 
 		 312 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2078  RecT protein  24.26 
 
 		 306 aa  42.4  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2041  RecT protein  24.26 
 
 		 306 aa  42.4  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0939  RecT family protein  25.98 
 
 		 289 aa  42.4  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>