More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1536 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1536  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  100 
 
 
198 aa  396  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0956  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.62 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001258  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1428  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.45 
 
 
225 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2023  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.51 
 
 
326 aa  101  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0150257  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0710  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.5 
 
 
331 aa  101  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1427  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.68 
 
 
198 aa  101  8e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0096  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.63 
 
 
354 aa  98.2  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1564  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.41 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.034899999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1193  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.51 
 
 
330 aa  96.7  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3718  translation factor SUA5  28.64 
 
 
216 aa  94.4  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1289  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.55 
 
 
338 aa  94  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.52734 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2395  translation factor SUA5  32.04 
 
 
352 aa  94  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0139  translation factor SUA5  33.17 
 
 
350 aa  94  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1580  translation factor SUA5  31.98 
 
 
337 aa  94  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08090  translation factor SUA5  30.65 
 
 
244 aa  93.2  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1783  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.62 
 
 
246 aa  93.2  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.37756  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0607  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  30.85 
 
 
364 aa  93.6  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97472  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0802  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.28 
 
 
194 aa  93.2  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.173581  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1843  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.21 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1012  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31 
 
 
216 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.837821  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0276  translation factor SUA5  30.73 
 
 
198 aa  92.4  4e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0460  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.39 
 
 
198 aa  92.4  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1185  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.16 
 
 
206 aa  91.3  8e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.909523  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.93 
 
 
348 aa  91.3  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.65 
 
 
327 aa  90.5  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.559973  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00240  hypothetical protein  25.41 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1789  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.57 
 
 
202 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0743  translation factor SUA5  36.64 
 
 
312 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.763495  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.49 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0108242  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0831  translation factor SUA5  32 
 
 
327 aa  90.5  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.167827  hitchhiker  0.00199309 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1188  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.96 
 
 
205 aa  89.4  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2612  translation factor SUA5  29.85 
 
 
215 aa  89.4  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0641  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.34 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00392606  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1753  translation factor SUA5  30.22 
 
 
219 aa  89.4  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.716353  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34 
 
 
350 aa  89  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2174  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34 
 
 
350 aa  89  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143173  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0835  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.81 
 
 
213 aa  88.2  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000200463  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0023  hypothetical protein  24.86 
 
 
185 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.841685  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0890  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  27.92 
 
 
215 aa  88.2  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1595  translation factor SUA5  28.79 
 
 
203 aa  87.8  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000829536  normal  0.144642 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1975  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.17 
 
 
190 aa  87  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213074  normal  0.800217 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2116  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.35 
 
 
235 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.839718  normal  0.0783676 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2399  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  35.88 
 
 
312 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2151  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.15 
 
 
358 aa  87  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0231  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.75 
 
 
335 aa  87.4  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00706793  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1129  translation factor SUA5  27.37 
 
 
342 aa  86.3  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.712413 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2463  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.83 
 
 
312 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.201158 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_739  translation factor SUA5  30.22 
 
 
213 aa  85.9  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000652312  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1995  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.05 
 
 
319 aa  86.3  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0774  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.91 
 
 
320 aa  85.9  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.902931  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0041  SUA5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.03 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00240763  normal  0.264838 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0735  hypothetical protein  32.07 
 
 
325 aa  86.3  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1674  Sua5/YciO/YrdC family protein  29.23 
 
 
328 aa  85.9  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1371  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.23 
 
 
328 aa  85.9  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1063  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.95 
 
 
236 aa  85.5  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1588  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.32 
 
 
317 aa  85.5  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.97 
 
 
335 aa  85.5  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1547  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.7 
 
 
198 aa  85.1  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2387  translation factor SUA5  31.49 
 
 
333 aa  85.1  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1658  Sua5_yciO_yrdC, YrdC domain protein  30.6 
 
 
221 aa  85.1  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1490  translation factor SUA5  33.51 
 
 
205 aa  84.7  8e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1722  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.39 
 
 
347 aa  84.7  9e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.231595  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3871  translation factor SUA5  31.67 
 
 
218 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.0428509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3885  translation factor SUA5  31.67 
 
 
218 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0609362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3959  translation factor SUA5  31.67 
 
 
218 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0058  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  25 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1596  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.23 
 
 
203 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2309  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.67 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.569528 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0134  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.51 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.17546 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1688  translation factor SUA5  30.63 
 
 
231 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.185545  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0754  translation factor SUA5  30.43 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00690198  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1307  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.42 
 
 
217 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.816543 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0807  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.88 
 
 
338 aa  84  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172547  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0044  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.72 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268227  normal  0.36574 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2417  translation factor SUA5  27.32 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.909334  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2350  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.1 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004285 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0389  Sua5/YciO/YrdC family protein  29.03 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.50354  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1686  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  28.5 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0444  translation factor SUA5  27.87 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4146  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.61 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0029  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  26.52 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.480067  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0404  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  27.53 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.459689  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1308  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.05 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5452  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  31.69 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228845  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1961  translation factor SUA5  31.89 
 
 
335 aa  82.4  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2152  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.45 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3747  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.33 
 
 
352 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.585251  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3895  translation factor SUA5  28.34 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2190  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  32.45 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.970506  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0445  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.7 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2395  hypothetical protein  31.15 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0037  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.65 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2595  translation factor SUA5  32.67 
 
 
351 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1839  translation factor SUA5  28.73 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.287256  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0067  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.9 
 
 
338 aa  82.4  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0048533  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0766  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.16 
 
 
206 aa  82  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0403  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.69 
 
 
316 aa  82  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0524  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.21 
 
 
332 aa  82  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0020  SUA5/yciO/yrdC-like  26.67 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000304623  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0888  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  24.73 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1466  normal  0.824188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>