50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19750 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_19750  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  462  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00552394  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2415  hypothetical protein  39.73 
 
 
235 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2783  hypothetical protein  29.65 
 
 
211 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0781526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2762  integral membrane protein  28.51 
 
 
207 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.342781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2804  integral membrane protein  28.51 
 
 
207 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2530  integral membrane protein  32.37 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000539484 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2555  hypothetical protein  30.05 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.011471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2372  hypothetical protein  30.63 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0588117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0473  hypothetical protein  30.63 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.690189  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2511  hypothetical protein  30.63 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1802  hypothetical protein  30.63 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0424  hypothetical protein  30.63 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0824  integral membrane protein  30.63 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.701818  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3191  hypothetical protein  39.32 
 
 
218 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0635  hypothetical protein  30.28 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0911562  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3812  hypothetical protein  33.9 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0260  hypothetical protein  32.12 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32420  hypothetical protein  37.8 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4455  hypothetical protein  35.64 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.554622  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3616  hypothetical protein  35.64 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3911  hypothetical protein  35.64 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4672  hypothetical protein  34.81 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.178311  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3289  hypothetical protein  33.16 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3805  hypothetical protein  33.16 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.404034  normal  0.773364 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2191  hypothetical protein  23.83 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2177  hypothetical protein  32.62 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.359775  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3297  hypothetical protein  27.27 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0105  hypothetical protein  30.2 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136053  normal  0.0348722 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1212  hypothetical protein  37.14 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194441  normal  0.436437 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0275  hypothetical protein  24.43 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02190  hypothetical protein  27.36 
 
 
230 aa  55.5  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0506  hypothetical protein  34.32 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000252365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0511  hypothetical protein  30.81 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0555837  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4177  hypothetical protein  27.39 
 
 
225 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3306  hypothetical protein  29.94 
 
 
227 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5984  hypothetical protein  28.92 
 
 
227 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.450186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2748  hypothetical protein  39.36 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.52306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4574  hypothetical protein  27.87 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0743  hypothetical protein  22.56 
 
 
208 aa  48.9  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.247142  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1274  hypothetical protein  27.59 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.28471  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2219  hypothetical protein  29.79 
 
 
173 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233822  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1155  hypothetical protein  24.88 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0848999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2236  hypothetical protein  31.48 
 
 
226 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.112154 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22720  hypothetical protein  25.56 
 
 
243 aa  43.5  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6016  hypothetical protein  28.23 
 
 
220 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.592779 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00260  hypothetical protein  29.46 
 
 
242 aa  42.4  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2553  hypothetical protein  27.84 
 
 
207 aa  42.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.284006  normal  0.21762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4194  hypothetical protein  29.46 
 
 
219 aa  42  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3928  hypothetical protein  27.2 
 
 
219 aa  42  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.811707  normal  0.0524532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1085  hypothetical protein  28.19 
 
 
226 aa  42  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>