43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1274 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1274  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  462  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.28471  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2783  hypothetical protein  33.93 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0781526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2762  integral membrane protein  34.07 
 
 		 207 aa  118  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.342781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2530  integral membrane protein  33.04 
 
 		 207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000539484 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2555  hypothetical protein  36.93 
 
 		 211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.011471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2804  integral membrane protein  32.86 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39512  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3191  hypothetical protein  37.43 
 
 		 218 aa  89.4  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0635  hypothetical protein  36.87 
 
 		 211 aa  85.9  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0911562  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3812  hypothetical protein  32.72 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0424  hypothetical protein  36.87 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1802  hypothetical protein  36.87 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2511  hypothetical protein  36.87 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2372  hypothetical protein  36.87 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0588117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0473  hypothetical protein  36.87 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.690189  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0824  integral membrane protein  36.87 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.701818  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0260  hypothetical protein  35.87 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3805  hypothetical protein  34.13 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.404034  normal  0.773364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3289  hypothetical protein  32.24 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2415  hypothetical protein  30.57 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3306  hypothetical protein  32.41 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3297  hypothetical protein  26.87 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2177  hypothetical protein  34.19 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.359775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0105  hypothetical protein  32.37 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136053  normal  0.0348722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4194  hypothetical protein  28.93 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4177  hypothetical protein  35 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4672  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.178311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3616  hypothetical protein  34.84 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3911  hypothetical protein  34.84 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4455  hypothetical protein  34.84 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.554622  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4273  hypothetical protein  29.41 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22720  hypothetical protein  30.37 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4574  hypothetical protein  27.57 
 
 		 212 aa  52  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0506  hypothetical protein  29.87 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000252365 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0526  hypothetical protein  31.46 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1448  hypothetical protein  28.88 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.601654  normal  0.316889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4357  hypothetical protein  29.26 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22140  hypothetical protein  28.92 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1085  hypothetical protein  27.47 
 
 		 226 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32420  hypothetical protein  32.04 
 
 		 221 aa  48.9  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3928  hypothetical protein  26.09 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.811707  normal  0.0524532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0511  hypothetical protein  27.47 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0555837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2748  hypothetical protein  28.89 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.52306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1212  hypothetical protein  29.17 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194441  normal  0.436437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>