55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0105 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0105  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  419  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136053  normal  0.0348722 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4177  hypothetical protein  57.28 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32420  hypothetical protein  49.03 
 
 		 221 aa  161  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3306  hypothetical protein  42.45 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1329  hypothetical protein  41.4 
 
 		 218 aa  131  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.385927  hitchhiker  0.00262088 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2783  hypothetical protein  35.12 
 
 		 211 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0781526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2530  integral membrane protein  34.68 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000539484 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2762  integral membrane protein  34.68 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.342781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2804  integral membrane protein  34.1 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39512  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22720  hypothetical protein  32.78 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00260  hypothetical protein  36.2 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0635  hypothetical protein  35.33 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0911562  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3297  hypothetical protein  28.02 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0424  hypothetical protein  35.93 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0824  integral membrane protein  35.93 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.701818  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1802  hypothetical protein  35.93 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2511  hypothetical protein  35.93 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2372  hypothetical protein  35.93 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0588117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0473  hypothetical protein  35.93 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.690189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2555  hypothetical protein  32.76 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.011471  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3191  hypothetical protein  32.64 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2748  hypothetical protein  34.08 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.52306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0260  hypothetical protein  39.85 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4194  hypothetical protein  32.27 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0526  hypothetical protein  34.46 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22140  hypothetical protein  38.64 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5984  hypothetical protein  30.23 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.450186 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3928  hypothetical protein  30.45 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.811707  normal  0.0524532 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1212  hypothetical protein  37.11 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194441  normal  0.436437 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4574  hypothetical protein  32.75 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2415  hypothetical protein  30.09 
 
 		 235 aa  62  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3812  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2219  hypothetical protein  28.57 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19750  hypothetical protein  32.24 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00552394  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3805  hypothetical protein  32.18 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.404034  normal  0.773364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3289  hypothetical protein  32.54 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2485  hypothetical protein  22.75 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2278  hypothetical protein  45.16 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal  0.0474109 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1085  hypothetical protein  30.46 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3616  hypothetical protein  38.71 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3911  hypothetical protein  38.71 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4455  hypothetical protein  38.71 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.554622  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1274  hypothetical protein  33.54 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.28471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2553  hypothetical protein  43.55 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.284006  normal  0.21762 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2191  hypothetical protein  26.82 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2177  hypothetical protein  36.96 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.359775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4672  hypothetical protein  41.94 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.178311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0511  hypothetical protein  30.18 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0555837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02190  hypothetical protein  34.04 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4357  hypothetical protein  29.82 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4273  hypothetical protein  30.36 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2236  hypothetical protein  39.34 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.112154 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0506  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000252365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1448  hypothetical protein  29.76 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.601654  normal  0.316889 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6016  hypothetical protein  28.1 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>