44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2415 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2415  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  461  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19750  hypothetical protein  40.2 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00552394  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2762  integral membrane protein  31.07 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.342781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2530  integral membrane protein  32.93 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000539484 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2804  integral membrane protein  32.93 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2783  hypothetical protein  32.34 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0781526  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2555  hypothetical protein  32.32 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.011471  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3191  hypothetical protein  31.28 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3805  hypothetical protein  27.81 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.404034  normal  0.773364 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0635  hypothetical protein  30.94 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0911562  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3289  hypothetical protein  27.27 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2372  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0588117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0473  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.690189  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2511  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1802  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0424  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0824  integral membrane protein  33.33 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.701818  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3812  hypothetical protein  30 
 
 
214 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2177  hypothetical protein  30.36 
 
 
212 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.359775  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3911  hypothetical protein  26.92 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0105  hypothetical protein  30.65 
 
 
221 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136053  normal  0.0348722 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4455  hypothetical protein  26.92 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.554622  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3616  hypothetical protein  26.92 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1033  hypothetical protein  28.04 
 
 
208 aa  59.7  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4672  hypothetical protein  27.18 
 
 
212 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.178311  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02190  hypothetical protein  31.01 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0260  hypothetical protein  33.54 
 
 
203 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2191  hypothetical protein  27.74 
 
 
236 aa  55.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1274  hypothetical protein  29.07 
 
 
236 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.28471  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3297  hypothetical protein  25.27 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32420  hypothetical protein  30.54 
 
 
221 aa  52.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1329  hypothetical protein  26.74 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.385927  hitchhiker  0.00262088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4177  hypothetical protein  30.56 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4574  hypothetical protein  25.41 
 
 
212 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0511  hypothetical protein  32.12 
 
 
217 aa  48.5  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0555837  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3306  hypothetical protein  32.39 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3299  hypothetical protein  31.33 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0654352  normal  0.14095 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3928  hypothetical protein  24.86 
 
 
219 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.811707  normal  0.0524532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0506  hypothetical protein  30.07 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000252365 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1212  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194441  normal  0.436437 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4194  hypothetical protein  25.41 
 
 
219 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4779  hypothetical protein  31.13 
 
 
214 aa  42  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2774  hypothetical protein  27.13 
 
 
215 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.152324  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2730  hypothetical protein  27.13 
 
 
215 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>