39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2730 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2730  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826821  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2774  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.152324  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2760  hypothetical protein  97.21 
 
 
215 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0499164  normal  0.364973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3299  hypothetical protein  61.08 
 
 
219 aa  211  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0654352  normal  0.14095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3020  hypothetical protein  67.03 
 
 
207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0309855  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4779  hypothetical protein  35.16 
 
 
214 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3297  hypothetical protein  28.3 
 
 
220 aa  55.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0635  hypothetical protein  34.53 
 
 
211 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0911562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2191  hypothetical protein  23.37 
 
 
236 aa  55.1  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2762  integral membrane protein  24.24 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.342781  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3289  hypothetical protein  34.16 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2804  integral membrane protein  25.26 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39512  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3805  hypothetical protein  33.54 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.404034  normal  0.773364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2530  integral membrane protein  24.38 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000539484 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0424  hypothetical protein  34.53 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0473  hypothetical protein  34.53 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.690189  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2372  hypothetical protein  34.53 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0588117  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2511  hypothetical protein  34.53 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1802  hypothetical protein  34.53 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0824  integral membrane protein  34.53 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.701818  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02190  hypothetical protein  31.09 
 
 
230 aa  52.4  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2783  hypothetical protein  26.58 
 
 
211 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0781526  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0260  hypothetical protein  35.82 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3911  hypothetical protein  31.61 
 
 
236 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2555  hypothetical protein  28.48 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.011471  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3616  hypothetical protein  31.61 
 
 
236 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4455  hypothetical protein  31.61 
 
 
236 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.554622  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3191  hypothetical protein  34.53 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2177  hypothetical protein  32.59 
 
 
212 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.359775  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32420  hypothetical protein  32.9 
 
 
221 aa  48.9  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0511  hypothetical protein  34.1 
 
 
217 aa  48.5  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0555837  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0275  hypothetical protein  24.12 
 
 
219 aa  48.1  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3812  hypothetical protein  28.87 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2748  hypothetical protein  35.77 
 
 
213 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.52306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3306  hypothetical protein  33.09 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4672  hypothetical protein  29.89 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.178311  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1033  hypothetical protein  26.81 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5984  hypothetical protein  32.84 
 
 
227 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.450186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2415  hypothetical protein  27.13 
 
 
235 aa  41.6  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>