43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0743 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0743  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  414  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.247142  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2191  hypothetical protein  36.07 
 
 
236 aa  91.7  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2485  hypothetical protein  34.91 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02190  hypothetical protein  26.83 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0275  hypothetical protein  27.22 
 
 
219 aa  72  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3928  hypothetical protein  27.91 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.811707  normal  0.0524532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4194  hypothetical protein  25.11 
 
 
219 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1448  hypothetical protein  27.78 
 
 
211 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.601654  normal  0.316889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4574  hypothetical protein  27.84 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4273  hypothetical protein  26.55 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1085  hypothetical protein  26.44 
 
 
226 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1033  hypothetical protein  26.24 
 
 
208 aa  58.5  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2748  hypothetical protein  26.35 
 
 
213 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.52306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3191  hypothetical protein  29.44 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0511  hypothetical protein  23.04 
 
 
217 aa  55.5  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0555837  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4357  hypothetical protein  24.44 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3297  hypothetical protein  27.33 
 
 
220 aa  52  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22720  hypothetical protein  27.93 
 
 
243 aa  50.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2804  integral membrane protein  30.89 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39512  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3805  hypothetical protein  26.83 
 
 
212 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.404034  normal  0.773364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2555  hypothetical protein  31.93 
 
 
211 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.011471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2530  integral membrane protein  27.68 
 
 
207 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000539484 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2783  hypothetical protein  27.12 
 
 
211 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0781526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2762  integral membrane protein  27.68 
 
 
207 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.342781  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1212  hypothetical protein  25.68 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194441  normal  0.436437 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2236  hypothetical protein  25.41 
 
 
226 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.112154 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3289  hypothetical protein  26.5 
 
 
236 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32420  hypothetical protein  23.17 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0526  hypothetical protein  23.29 
 
 
205 aa  45.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5984  hypothetical protein  22.53 
 
 
227 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.450186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2278  hypothetical protein  24.14 
 
 
207 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal  0.0474109 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0473  hypothetical protein  24.46 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.690189  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2372  hypothetical protein  24.46 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0588117  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2553  hypothetical protein  23.65 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.284006  normal  0.21762 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0424  hypothetical protein  24.46 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2511  hypothetical protein  24.46 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1802  hypothetical protein  24.46 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0824  integral membrane protein  24.46 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.701818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3299  hypothetical protein  26.87 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0654352  normal  0.14095 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0635  hypothetical protein  24.46 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0911562  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2760  hypothetical protein  25.53 
 
 
215 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0499164  normal  0.364973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1329  hypothetical protein  18.22 
 
 
218 aa  42.4  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.385927  hitchhiker  0.00262088 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3306  hypothetical protein  25.41 
 
 
227 aa  41.6  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>