23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0815 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0815  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0687  hypothetical protein  44.38 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0295082  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0891  hypothetical protein  34.58 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31620  hypothetical protein  35.96 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0776  hypothetical protein  32.24 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2942  hypothetical protein  35.47 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.362789  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2058  hypothetical protein  39.45 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07600  hypothetical protein  30.43 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3990  hypothetical protein  41 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0716  hypothetical protein  27.64 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.800292 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34530  hypothetical protein  30.84 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0777  hypothetical protein  42.37 
 
 		 416 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15160  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  36.14 
 
 		 528 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.481311  normal  0.251457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0087  hypothetical protein  36.63 
 
 		 470 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  29.92 
 
 		 490 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.8 
 
 		 465 aa  44.7  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1726  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.23 
 
 		 493 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  44.64 
 
 		 480 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0249  cell envelope-related transcriptional attenuator  40 
 
 		 461 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176246  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.98 
 
 		 521 aa  42.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.43 
 
 		 495 aa  42  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0098  hypothetical protein  30.56 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.04 
 
 		 520 aa  41.2  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>