32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0470 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0470  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0586  tRNA-Arg  86.15 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00782572  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  88.89 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.500837  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0035  tRNA-Arg  86.54 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2650599999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0034  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0037  tRNA-Arg  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0012  tRNA-Arg  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0247478  normal  0.430055 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309279  tRNA-Arg  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0011  tRNA-His  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0065  tRNA-His  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0055  tRNA-His  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0057  tRNA-His  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20058  hitchhiker  0.00682829 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0126  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000000558638  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2217  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000193879  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0034  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.1136  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0025  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna022  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000131099  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0015  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.776869  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0038  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0257046  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0024  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.893816  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_003295  RS05228  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0083  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000703171  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg01  tRNA-Arg  100 
 
 
80 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000810736  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3097t  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000646764  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0026  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.863353  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0048  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00409102  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0024  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264757  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00485  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>