24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6583 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6583    100 
 
 
192 bp  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300853  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4251  integrase catalytic region  96.35 
 
 
903 bp  325  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564242 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5774  transposase  95.83 
 
 
375 bp  317  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39486  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0096  transposase  92.71 
 
 
888 bp  270  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.679096  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0366  transposase  92.71 
 
 
888 bp  270  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1453  transposase  92.71 
 
 
888 bp  270  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1536  transposase  92.71 
 
 
888 bp  270  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2744  transposase  92.71 
 
 
888 bp  270  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.936564  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2584  transposase  92.19 
 
 
888 bp  262  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161826  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1830  ISRSO10-transposase ORFB protein  88.48 
 
 
849 bp  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.189696  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2331  ISRSO10-transposase ORFB protein  88.48 
 
 
888 bp  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0460  ISRSO10-transposase ORFB protein  88.48 
 
 
603 bp  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112224  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1435  ISRSO10-transposase ORFB protein  88.48 
 
 
603 bp  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0927886  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0567  ISRSO10-transposase ORFB protein  86.67 
 
 
849 bp  153  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3635    83.64 
 
 
198 bp  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000645875  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1792  integrase catalytic region  83.94 
 
 
846 bp  97.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.540172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3620  hypothetical protein  90.24 
 
 
294 bp  50.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.567327  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6833  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 
837 bp  48.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5055  integrase catalytic region  93.75 
 
 
837 bp  48.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5094  integrase catalytic region  93.75 
 
 
837 bp  48.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5559    93.75 
 
 
6537 bp  48.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.261619 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5564  integrase catalytic region  93.75 
 
 
837 bp  48.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.923042  normal  0.135572 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1930  transposase  93.75 
 
 
894 bp  48.1  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3308  transposase  93.55 
 
 
138 bp  46.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>