22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2300 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A2297  hypothetical protein  87.31 
 
 
385 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2008  hypothetical protein  85.18 
 
 
412 aa  641    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3062  hypothetical protein  87.05 
 
 
385 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1406  hypothetical protein  85.43 
 
 
406 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2300  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  898    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1032  hypothetical protein  87.31 
 
 
385 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3188  hypothetical protein  87.56 
 
 
385 aa  644    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1318  hypothetical protein  87.31 
 
 
385 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0887  hypothetical protein  51.17 
 
 
343 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2451  hypothetical protein  51.17 
 
 
343 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2587  hypothetical protein  51.17 
 
 
343 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.579093  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0575  hypothetical protein  48.95 
 
 
343 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0277  hypothetical protein  48.33 
 
 
295 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130975  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0310  hypothetical protein  48.33 
 
 
295 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000292175  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1655  hypothetical protein  48.33 
 
 
295 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1458  hypothetical protein  48.33 
 
 
295 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1405  hypothetical protein  93.1 
 
 
614 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5478  LuxR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
256 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.336666 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0875  LuxR family transcriptional regulator  24.07 
 
 
254 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  22 
 
 
247 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  23.08 
 
 
247 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
234 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>