26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5478 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5478  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  532  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.336666 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0575  hypothetical protein  26.1 
 
 		 343 aa  93.2  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2451  hypothetical protein  26.29 
 
 		 343 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0887  hypothetical protein  26.29 
 
 		 343 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2587  hypothetical protein  26.29 
 
 		 343 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.579093  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2297  hypothetical protein  28.38 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3062  hypothetical protein  28.38 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1318  hypothetical protein  28.38 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1032  hypothetical protein  28.38 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2008  hypothetical protein  28.38 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3188  hypothetical protein  27.95 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1406  hypothetical protein  27.95 
 
 		 406 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2300  hypothetical protein  27.07 
 
 		 442 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0875  LuxR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1458  hypothetical protein  26.52 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1655  hypothetical protein  26.52 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0310  hypothetical protein  26.52 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000292175  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0277  hypothetical protein  26.52 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130975  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2115  transcriptional regulator, LuxR family  25.13 
 
 		 267 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 229 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.17 
 
 		 425 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  21.43 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  23.81 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3796  LuxR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  22.89 
 
 		 244 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>