20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1032 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A2297  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  778    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2008  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  778    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1406  hypothetical protein  99.74 
 
 		 406 aa  776    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2300  hypothetical protein  87.31 
 
 		 442 aa  634    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3062  hypothetical protein  99.74 
 
 		 385 aa  777    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1032  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  778    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1318  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  778    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3188  hypothetical protein  99.74 
 
 		 385 aa  775    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2451  hypothetical protein  52.21 
 
 		 343 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0887  hypothetical protein  51.69 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2587  hypothetical protein  51.69 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.579093  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0575  hypothetical protein  51.04 
 
 		 343 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0277  hypothetical protein  48.94 
 
 		 295 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130975  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0310  hypothetical protein  48.94 
 
 		 295 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000292175  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1655  hypothetical protein  48.94 
 
 		 295 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1458  hypothetical protein  48.94 
 
 		 295 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5478  LuxR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 256 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.336666 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0875  LuxR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 254 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  23.62 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  22.5 
 
 		 247 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>