20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0887 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0887  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0575  hypothetical protein  88.05 
 
 
343 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2451  hypothetical protein  99.71 
 
 
343 aa  711    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2587  hypothetical protein  99.71 
 
 
343 aa  713    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.579093  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0277  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  603  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130975  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0310  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  603  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000292175  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1458  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  603  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1655  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  603  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2008  hypothetical protein  51.69 
 
 
412 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2297  hypothetical protein  51.69 
 
 
385 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3062  hypothetical protein  51.69 
 
 
385 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3188  hypothetical protein  51.69 
 
 
385 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1318  hypothetical protein  51.69 
 
 
385 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1032  hypothetical protein  51.69 
 
 
385 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1406  hypothetical protein  51.69 
 
 
406 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2300  hypothetical protein  51.17 
 
 
442 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5478  LuxR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.336666 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  23.56 
 
 
229 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0875  LuxR family transcriptional regulator  23.96 
 
 
254 aa  42.7  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1819  putative transcriptional regulator  26.01 
 
 
243 aa  42.7  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145412  normal  0.357363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>