24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B3659 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B3659  RNA polymerase sigma-70 factor  100 
 
 
87 aa  175  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.80864  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1685  RNA polymerase factor sigma-70  86.59 
 
 
179 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1533  RNA polymerase factor sigma-70  87.5 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.373295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1493  RNA polymerase factor sigma-70  86.25 
 
 
179 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.225299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1502  RNA polymerase factor sigma-70  86.25 
 
 
179 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000980591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1792  RNA polymerase factor sigma-70  81.71 
 
 
179 aa  133  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5322  RNA polymerase factor sigma-70  37.08 
 
 
190 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4639  RNA polymerase factor sigma-70  31.4 
 
 
181 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0440  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.23 
 
 
181 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588556 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3970  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.92 
 
 
183 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4204  sigma-70 region 2 domain-containing protein  25.61 
 
 
217 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1326  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.82 
 
 
179 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000354416 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1626  RNA polymerase factor sigma-70  36.23 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000238323  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1587  RNA polymerase factor sigma-70  35.94 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.40147e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1753  RNA polymerase factor sigma-70  36.23 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792088  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1886  RNA polymerase factor sigma-70  35.94 
 
 
188 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00957096  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1578  RNA polymerase factor sigma-70  35.94 
 
 
188 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000134399  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1803  RNA polymerase factor sigma-70  35.94 
 
 
188 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1768  RNA polymerase factor sigma-70  35.71 
 
 
188 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.203942  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1626  RNA polymerase factor sigma-70  33.33 
 
 
182 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3574  RNA polymerase factor sigma-70  35.71 
 
 
188 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1829  RNA polymerase factor sigma-70  33.33 
 
 
188 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00470761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0512  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  27.71 
 
 
183 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.196327  normal  0.0867918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4471  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30 
 
 
236 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.368795 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>