More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A4639 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A4639  RNA polymerase factor sigma-70  100 
 
 
181 aa  361  3e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5322  RNA polymerase factor sigma-70  75.84 
 
 
190 aa  284  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3970  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  40 
 
 
183 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1493  RNA polymerase factor sigma-70  34.09 
 
 
179 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.225299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1533  RNA polymerase factor sigma-70  34.68 
 
 
181 aa  121  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.373295  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1685  RNA polymerase factor sigma-70  34.1 
 
 
179 aa  121  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1792  RNA polymerase factor sigma-70  32.97 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1502  RNA polymerase factor sigma-70  34.66 
 
 
179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000980591  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1587  RNA polymerase factor sigma-70  33.73 
 
 
188 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.40147e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1803  RNA polymerase factor sigma-70  33.73 
 
 
188 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1768  RNA polymerase factor sigma-70  33.73 
 
 
188 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.203942  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1626  RNA polymerase factor sigma-70  33.73 
 
 
188 aa  101  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000238323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1578  RNA polymerase factor sigma-70  33.73 
 
 
188 aa  101  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000134399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1753  RNA polymerase factor sigma-70  33.73 
 
 
188 aa  101  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792088  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1886  RNA polymerase factor sigma-70  33.73 
 
 
188 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00957096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1326  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.61 
 
 
179 aa  101  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000354416 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1829  RNA polymerase factor sigma-70  33.13 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00470761  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3574  RNA polymerase factor sigma-70  33.13 
 
 
188 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0440  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.34 
 
 
181 aa  95.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588556 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1626  RNA polymerase factor sigma-70  31.33 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2113  RNA polymerase factor sigma-70  28.98 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0350  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.07 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0293923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0709  RNA polymerase sigma factor  28.41 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3071  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.07 
 
 
184 aa  62.4  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0226  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.54 
 
 
191 aa  62.4  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1521  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  21.35 
 
 
190 aa  62  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2628  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.12 
 
 
185 aa  61.6  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4471  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  23.53 
 
 
236 aa  61.2  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.368795 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3681  RNA polymerase sigma factor  26.86 
 
 
207 aa  61.2  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2016  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.82 
 
 
225 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0366  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.87 
 
 
189 aa  60.5  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1333  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25.14 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0246  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.57 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1907  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  23.86 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0415  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.35 
 
 
198 aa  59.3  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.261796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4541  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.81 
 
 
181 aa  59.3  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0412674 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1629  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.01 
 
 
230 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195635  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3258  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.86 
 
 
191 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.420669  normal  0.111032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0940  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  26.28 
 
 
195 aa  58.9  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318933  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4377  RNA polymerase sigma factor  26.01 
 
 
203 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2966  RNA polymerase sigma factor  30 
 
 
192 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000101714 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0362  RNA polymerase sigma factor  24.11 
 
 
188 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3056  RNA polymerase sigma factor  26.95 
 
 
203 aa  58.2  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331913  normal  0.0420414 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2758  RNA polymerase sigma factor  29.79 
 
 
192 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000734686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2970  RNA polymerase sigma factor  29.79 
 
 
192 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801574  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0093  RNA polymerase sigma factor  24.57 
 
 
203 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0863  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.57 
 
 
190 aa  57.8  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  4.44823e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2248  RNA polymerase sigma factor  26.14 
 
 
189 aa  57  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.647774  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2659  RNA polymerase sigma factor  26.92 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0545  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  24.71 
 
 
175 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.54892  normal  0.0924037 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2428  RNA polymerase  24.86 
 
 
178 aa  57  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.994959  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5176  RNA polymerase sigma-70 family protein  23.4 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0756  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.2 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5278  RNA polymerase sigma factor  26.01 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4446  LuxR family transcriptional regulator  26.38 
 
 
165 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0133892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4049  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.47 
 
 
186 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3807  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  24.65 
 
 
192 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184385  normal  0.356055 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01571  putative RNA polymerase sigma factor (ECF family) protein  24.81 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3158  RNA polymerase sigma factor  25.42 
 
 
233 aa  55.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148477  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0521  sigma-70 region 2:sigma-70 region 4  27.14 
 
 
166 aa  55.5  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4668  RNA polymerase sigma factor  26.67 
 
 
203 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488765  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0514  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  26.11 
 
 
184 aa  55.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.147298  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3726  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.52 
 
 
186 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1920  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  22.56 
 
 
198 aa  55.1  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0798561  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2004  RNA polymerase sigma factor  25.43 
 
 
196 aa  55.1  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0181  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.26 
 
 
196 aa  54.7  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.909527 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3591  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  23.84 
 
 
176 aa  54.7  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0457424  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1098  sigma-24 (FecI-like)  22.73 
 
 
204 aa  54.7  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0696  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  24.6 
 
 
211 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000147428  decreased coverage  0.0000446652 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3659  RNA polymerase sigma-70 factor  31.4 
 
 
87 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.80864  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4988  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.78 
 
 
158 aa  54.3  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.88444  normal  0.236889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3888  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  24.4 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.178328  normal  0.202136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4256  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.4 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.638432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3194  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  23.12 
 
 
232 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1474  ECF sigma factor  23.35 
 
 
188 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2258  RNA polymerase sigma factor  26.44 
 
 
211 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1169  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  20.69 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.362742 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1294  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  24.06 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4573  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25 
 
 
206 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0706  RNA polymerase sigma factor  25.27 
 
 
232 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3006  RNA polymerase sigma factor  24.1 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246764  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_002950  PG1660  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  24.56 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.379101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2022  RNA polymerase sigma factor  25.81 
 
 
189 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2662  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.14 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.81941e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7564  RNA polymerase sigma factor  22.41 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3057  RNA polymerase sigma factor  24.14 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3746  RNA polymerase sigma factor  22.73 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0245  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.12 
 
 
167 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0865  RNA polymerase sigma factor  25.84 
 
 
227 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2936  RNA polymerase sigma factor RpoE  22.3 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.270397  normal  0.0409988 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12208  putative RNA polymerase sigma factor  22.91 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.812607  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0154  RNA polymerase sigma factor SigW  25.56 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000564665  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2686  RNA polymerase sigma factor  23.91 
 
 
202 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.871223  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0342  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.32 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1667  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  24.29 
 
 
195 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0248741  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3011  RNA polymerase sigma factor  26.47 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2776  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  23.49 
 
 
173 aa  52  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.722977  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0274  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  22.06 
 
 
194 aa  52.4  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.561325  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0759  RNA polymerase sigma factor  24.14 
 
 
223 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.777163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0162  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.89 
 
 
201 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>