11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5278 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5278  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  701    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.763948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1556  hypothetical protein  28.01 
 
 		 329 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.703276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3019  hypothetical protein  31.34 
 
 		 345 aa  112  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5240  hypothetical protein  27.78 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111977  normal  0.759757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6660  hypothetical protein  26.95 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.736332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1693  hypothetical protein  28.99 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.189975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2449  hypothetical protein  26.17 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3406  hypothetical protein  25.22 
 
 		 375 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396982  normal  0.0134437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3536  hypothetical protein  30.54 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.585971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2380  hypothetical protein  28 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.730708  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44652  predicted protein  20.11 
 
 		 412 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>