13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1693 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1693  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  813    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.189975 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44652  predicted protein  33.58 
 
 
412 aa  202  7e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3019  hypothetical protein  24.11 
 
 
345 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5278  hypothetical protein  28.99 
 
 
348 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.763948  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07517  HypA-like protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03330)  25.85 
 
 
444 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0569575  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3536  hypothetical protein  29.53 
 
 
323 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.585971  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5240  hypothetical protein  31.3 
 
 
407 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111977  normal  0.759757 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10370  hypothetical protein  26.28 
 
 
411 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.59993 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1556  hypothetical protein  35.14 
 
 
329 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.703276  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00310  expressed protein  24.26 
 
 
490 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2449  hypothetical protein  21.07 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6660  hypothetical protein  30.36 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.736332  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3406  hypothetical protein  32.03 
 
 
375 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396982  normal  0.0134437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>