9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2380 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2380  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  654    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.730708  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5240  hypothetical protein  51.2 
 
 		 407 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111977  normal  0.759757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6660  hypothetical protein  41.18 
 
 		 336 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.736332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3406  hypothetical protein  33.33 
 
 		 375 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396982  normal  0.0134437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3536  hypothetical protein  28.4 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.585971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3019  hypothetical protein  32.76 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1556  hypothetical protein  22.15 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.703276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2133  hypothetical protein  49.48 
 
 		 107 aa  53.1  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.722362  normal  0.240575 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5278  hypothetical protein  28.65 
 
 		 348 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.763948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>