49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1168 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1168  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  341  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193996  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  39.86 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0567  GCN5-related N-acetyltransferase  41.51 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124844 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1385  hypothetical protein  34.59 
 
 		 170 aa  84.7  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001151  GCN5-related N-acetyltransferase  37.39 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000057188  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06631  acetyltransferase  32.67 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7479  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.86 
 
 		 547 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1894  GCN5-related N-acetyltransferase  26.51 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0698465  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2203  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 		 286 aa  61.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2165  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 		 286 aa  61.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3654  acetyltransferase, GNAT family  31.69 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.629654  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1736  acetyltransferase  29.8 
 
 		 286 aa  54.3  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1821  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0133724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0962  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4647  GCN5-related N-acetyltransferase  28.4 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2362  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2479  acetyltransferase  28.31 
 
 		 165 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000166388  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2968  diamine N-acetyltransferase (spermine/spermidine acetyltransferase)  21.54 
 
 		 149 aa  51.2  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3059  acetyltransferase, gnat family  27.85 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2744  acetyltransferase  27.95 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2752  acetyltransferase, gnat family  27.95 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000342848 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2514  acetyltransferase  27.95 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2798  acetyltransferase, gnat family  27.95 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.916209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2558  acetyltransferase  27.95 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00338147  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4329  GCN5-related N-acetyltransferase  43.94 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.086344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2756  acetyltransferase, GNAT family  26.06 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.4144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2536  acetyltransferase, GNAT family  27.95 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053361 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3210  diamine N-acetyltransferase  21.26 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2777  acetyltransferase  27.38 
 
 		 165 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0036205  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1598  GCN5-related N-acetyltransferase  42.5 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.142916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  27.11 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00116059  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1763  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36 
 
 		 138 aa  45.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1060  spermine/spermidine acetyltransferase, putative  31 
 
 		 160 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0364556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1593  GCN5-related N-acetyltransferase  43.42 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000671583 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0894  acetyltransferase  31 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000309143  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1451  GCN5-related N-acetyltransferase  26.55 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2347  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.820631  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0044  acetyltransferase  25.26 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0002  acetyltransferase  25.26 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0500  GCN5-related N-acetyltransferase  30.16 
 
 		 178 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.571408  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01903  hypothetical protein  23.03 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3258  GCN5-related N-acetyltransferase  26.62 
 
 		 226 aa  42  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0565  acetyltransferase  39.62 
 
 		 165 aa  42  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00392228  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1042  GCN5-related N-acetyltransferase  20.65 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818155  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1167  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 		 291 aa  41.6  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000126694  unclonable  0.0000000357828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  hitchhiker  0.00000000407656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0439  transketolase  26.4 
 
 		 146 aa  40.8  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0502  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 		 161 aa  40.4  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.401005  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0489  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 		 161 aa  40.4  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>