46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4647 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4647  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
159 aa  320  7e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3654  acetyltransferase, GNAT family  44.65 
 
 
162 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.629654  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4329  GCN5-related N-acetyltransferase  41.77 
 
 
161 aa  134  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.086344  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1821  GCN5-related N-acetyltransferase  44.03 
 
 
162 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0133724  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0962  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
175 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2362  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0567  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124844 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0502  GCN5-related N-acetyltransferase  27.64 
 
 
161 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.401005  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0489  GCN5-related N-acetyltransferase  27.64 
 
 
161 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1894  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
166 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0698465  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2479  acetyltransferase  25.34 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000166388  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2752  acetyltransferase, gnat family  24.66 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000342848 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00116059  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2744  acetyltransferase  24.66 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2514  acetyltransferase  24.66 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2558  acetyltransferase  24.66 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00338147  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1736  acetyltransferase  30 
 
 
286 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2798  acetyltransferase, gnat family  24.66 
 
 
165 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.916209  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2536  acetyltransferase, GNAT family  25.52 
 
 
165 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053361 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2777  acetyltransferase  23.45 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0036205  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2203  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 
286 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2165  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 
286 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1168  hypothetical protein  28.4 
 
 
166 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193996  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7479  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.76 
 
 
547 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78277  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2756  acetyltransferase, GNAT family  27.05 
 
 
165 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.4144  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1385  hypothetical protein  40.32 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2968  diamine N-acetyltransferase (spermine/spermidine acetyltransferase)  22.46 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1593  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 
180 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000671583 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0038  GCN5-related N-acetyltransferase  38.54 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000142621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2571  GCN5-related N-acetyltransferase  32.84 
 
 
163 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000321902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2006  GCN5-related N-acetyltransferase  36.07 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0135971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2466  GCN5-related N-acetyltransferase  24.14 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.183058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3210  diamine N-acetyltransferase  21.74 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32833  predicted protein  37.5 
 
 
376 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.742524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8955  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316423  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000218796  hitchhiker  0.000817429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2347  GCN5-related N-acetyltransferase  31.67 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.820631  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.847229 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2687  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
185 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000216102  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2612  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155253  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1867  ribosomal protein (S18)-alanine acetyltransferase  31.17 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.216572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3059  acetyltransferase, gnat family  24.35 
 
 
155 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1598  GCN5-related N-acetyltransferase  26.99 
 
 
171 aa  41.6  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.142916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  33.04 
 
 
162 aa  41.2  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.858173 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001151  GCN5-related N-acetyltransferase  29.69 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000057188  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2870  acetyltransferase  29.03 
 
 
160 aa  40.8  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>