42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1385 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1385  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  352  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  42.26 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001151  GCN5-related N-acetyltransferase  39.76 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000057188  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06631  acetyltransferase  37.5 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0567  GCN5-related N-acetyltransferase  34.94 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124844 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1168  hypothetical protein  34.59 
 
 		 166 aa  84.7  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1821  GCN5-related N-acetyltransferase  33.97 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0133724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0962  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3654  acetyltransferase, GNAT family  33.97 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.629654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3059  acetyltransferase, gnat family  37.78 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1894  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0698465  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4329  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.086344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2165  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2203  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  30.18 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00116059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0489  GCN5-related N-acetyltransferase  27.16 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0502  GCN5-related N-acetyltransferase  27.16 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.401005  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2362  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7479  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.69 
 
 		 547 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78277  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2777  acetyltransferase  32.03 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0036205  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2744  acetyltransferase  27.98 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2798  acetyltransferase, gnat family  27.38 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.916209  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1736  acetyltransferase  29.23 
 
 		 286 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2558  acetyltransferase  27.98 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00338147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2756  acetyltransferase, GNAT family  35.92 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.4144  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2514  acetyltransferase  27.38 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2479  acetyltransferase  26.79 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000166388  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1593  GCN5-related N-acetyltransferase  41.98 
 
 		 180 aa  52  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000671583 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2752  acetyltransferase, gnat family  27.38 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000342848 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1598  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 171 aa  51.6  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.142916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2536  acetyltransferase, GNAT family  33.33 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4647  GCN5-related N-acetyltransferase  40.32 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2712  spermine/spermidine acetyltransferase  25.79 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2466  GCN5-related N-acetyltransferase  30.21 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.183058  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0200  GCN5-related protein N-acetyltransferase  30.68 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1042  GCN5-related N-acetyltransferase  27.92 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818155  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0002  acetyltransferase  27.33 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0044  acetyltransferase  27.33 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1670  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2451  spermine/spermidine acetyltransferase  25.15 
 
 		 152 aa  41.2  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000397636  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 		 114 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242701  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2697  acetyltransferase, GNAT family  25.48 
 
 		 152 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>