45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1736 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1736  acetyltransferase  100 
 
 
286 aa  589  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2203  GCN5-related N-acetyltransferase  68.93 
 
 
286 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2165  GCN5-related N-acetyltransferase  68.93 
 
 
286 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2362  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3059  acetyltransferase, gnat family  29.58 
 
 
155 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2479  acetyltransferase  29.94 
 
 
165 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000166388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0962  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
175 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2514  acetyltransferase  29.3 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2798  acetyltransferase, gnat family  29.3 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.916209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2777  acetyltransferase  28.66 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0036205  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2752  acetyltransferase, gnat family  29.3 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000342848 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2558  acetyltransferase  28.66 
 
 
165 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00338147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2744  acetyltransferase  28.66 
 
 
165 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2536  acetyltransferase, GNAT family  28.03 
 
 
165 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2756  acetyltransferase, GNAT family  27.39 
 
 
165 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.4144  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1894  GCN5-related N-acetyltransferase  27.95 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0698465  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  25.48 
 
 
165 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00116059  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3654  acetyltransferase, GNAT family  29.93 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.629654  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1821  GCN5-related N-acetyltransferase  29.19 
 
 
162 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0133724  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06631  acetyltransferase  30.72 
 
 
158 aa  59.3  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0489  GCN5-related N-acetyltransferase  27.05 
 
 
161 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0502  GCN5-related N-acetyltransferase  27.05 
 
 
161 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.401005  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4647  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
159 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 
165 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1168  hypothetical protein  29.8 
 
 
166 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193996  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001151  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 
156 aa  53.9  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000057188  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1385  hypothetical protein  29.23 
 
 
170 aa  53.5  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4329  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 
161 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.086344  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7479  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.91 
 
 
547 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78277  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0567  GCN5-related N-acetyltransferase  23.97 
 
 
167 aa  49.7  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124844 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3210  diamine N-acetyltransferase  31.46 
 
 
149 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2968  diamine N-acetyltransferase (spermine/spermidine acetyltransferase)  31.46 
 
 
149 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2805  GCN5-related N-acetyltransferase  27.16 
 
 
134 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.121712  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1586  acetyltransferase  27.16 
 
 
130 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.569606  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2760  GCN5-related N-acetyltransferase  27.16 
 
 
134 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1884  GCN5-related N-acetyltransferase  26.53 
 
 
156 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0722359  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0126  diamine N-acetyltransferase  27.87 
 
 
186 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0111  diamine N-acetyltransferase  27.87 
 
 
186 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000137834  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
175 aa  43.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1167  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 
291 aa  42.7  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000126694  unclonable  0.0000000357828 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0176  GCN5-related N-acetyltransferase  26.88 
 
 
173 aa  42.7  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.135178  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0081  spermidine n(1)-acetyltransferase  26.92 
 
 
194 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000286884  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0317  spermidine n(1)-acetyltransferase  28.83 
 
 
239 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000406096  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2896  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 
198 aa  42.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1606  GCN5-related N-acetyltransferase  28.45 
 
 
180 aa  42  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0984019  normal  0.573216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>