60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3654 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3654  acetyltransferase, GNAT family  100 
 
 
162 aa  333  7e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.629654  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1821  GCN5-related N-acetyltransferase  85.19 
 
 
162 aa  286  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0133724  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4329  GCN5-related N-acetyltransferase  58.75 
 
 
161 aa  187  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.086344  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4647  GCN5-related N-acetyltransferase  44.65 
 
 
159 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7479  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.48 
 
 
547 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78277  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2362  GCN5-related N-acetyltransferase  39.25 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1385  hypothetical protein  33.97 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001151  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000057188  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1736  acetyltransferase  29.93 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0962  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 
175 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1894  GCN5-related N-acetyltransferase  27.04 
 
 
166 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0698465  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0502  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 
161 aa  61.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.401005  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0489  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 
161 aa  61.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2203  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 
286 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2165  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 
286 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0567  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124844 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06631  acetyltransferase  30.22 
 
 
158 aa  58.9  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1168  hypothetical protein  31.69 
 
 
166 aa  58.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2744  acetyltransferase  28.29 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2558  acetyltransferase  28.29 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00338147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3059  acetyltransferase, gnat family  30.61 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2798  acetyltransferase, gnat family  28.29 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.916209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2514  acetyltransferase  28.29 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2479  acetyltransferase  27.63 
 
 
165 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000166388  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2752  acetyltransferase, gnat family  28.29 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000342848 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2756  acetyltransferase, GNAT family  28.26 
 
 
165 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.4144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2777  acetyltransferase  28.26 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0036205  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2536  acetyltransferase, GNAT family  27.63 
 
 
165 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053361 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
165 aa  54.3  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00116059  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1593  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
180 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000671583 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 
188 aa  48.9  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2466  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.183058  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0808  acetyltransferase  25.74 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.564267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2451  spermine/spermidine acetyltransferase  25 
 
 
152 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000397636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2712  spermine/spermidine acetyltransferase  26.67 
 
 
152 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2689  acetyltransferase, GNAT family  25 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000963975 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2697  acetyltransferase, GNAT family  25.93 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1598  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
171 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.142916  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2571  GCN5-related N-acetyltransferase  43.4 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000321902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0978  spermidine acetyltransferase  39.68 
 
 
165 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2491  spermine/spermidine acetyltransferase  24.26 
 
 
145 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.757361  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2740  acetyltransferase, GNAT family  24.26 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000279684  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1167  GCN5-related N-acetyltransferase  28.75 
 
 
291 aa  44.3  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000126694  unclonable  0.0000000357828 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2422  spermine/spermidine acetyltransferase  24.26 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.178772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10740  spermidine acetyltransferase  39.68 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2687  GCN5-related N-acetyltransferase  41.51 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000216102  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  41.51 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000218796  hitchhiker  0.000817429 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2613  acetyltransferase, GNAT family  23.7 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  hitchhiker  0.0000020921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2612  GCN5-related N-acetyltransferase  41.51 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155253  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0451  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  36.96 
 
 
295 aa  42.4  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.237261  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003153  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 
155 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00672555  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32833  predicted protein  33.33 
 
 
376 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.742524  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0124  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6547  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.1 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3272  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
194 aa  41.6  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0150015 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4857  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
166 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5404  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
166 aa  40.8  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0298216  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2006  GCN5-related N-acetyltransferase  39.34 
 
 
166 aa  40.8  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0135971  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2870  acetyltransferase  43.14 
 
 
160 aa  40.4  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>