148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2305 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2305  glutamine amidotransferase subunit PdxT  100 
 
 
236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00618121  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2035  glutamine amidotransferase subunit PdxT  83.05 
 
 
236 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000103921 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15360  pyridoxal phosphate synthase yaaE subunit  60.73 
 
 
212 aa  238  6.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132239  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1664  SNO glutamine amidotransferase  57.14 
 
 
213 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0590929  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2067  SNO glutamine amidotransferase  58.33 
 
 
196 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2382  SNO glutamine amidotransferase  55.5 
 
 
201 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2298  SNO glutamine amidotransferase  55.7 
 
 
211 aa  221  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1792  SNO glutamine amidotransferase  55.76 
 
 
203 aa  219  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.369392  normal  0.171036 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3058  SNO glutamine amidotransferase  54.94 
 
 
207 aa  219  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293498  normal  0.634434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2350  SNO glutamine amidotransferase  56.74 
 
 
204 aa  218  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2107  SNO glutamine amidotransferase  51.91 
 
 
219 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0846545  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2250  glutamine amidotransferase subunit PdxT  54.42 
 
 
206 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0531826  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2297  glutamine amidotransferase subunit PdxT  54.42 
 
 
206 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1988  SNO glutamine amidotransferase  57.21 
 
 
200 aa  217  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0824  SNO glutamine amidotransferase  53.88 
 
 
202 aa  216  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589495  normal  0.0695207 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2097  glutamine amidotransferase subunit PdxT  58.26 
 
 
201 aa  215  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2289  glutamine amidotransferase subunit PdxT  54.42 
 
 
206 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3180  SNO glutamine amidotransferase  54.13 
 
 
217 aa  215  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2566  glutamine amidotransferase subunit PdxT  55.87 
 
 
195 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2109  SNO glutamine amidotransferase  54.34 
 
 
204 aa  214  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0561786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6117  SNO glutamine amidotransferase family  53.7 
 
 
196 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298038  normal  0.336811 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1930  SNO glutamine amidotransferase  54.13 
 
 
201 aa  208  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142807  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5148  glutamine amidotransferase subunit PdxT  56.36 
 
 
203 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00302911  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1778  SNO glutamine amidotransferase  54.63 
 
 
201 aa  203  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1367  glutamine amidotransferase subunit PdxT  52.49 
 
 
199 aa  201  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1347  glutamine amidotransferase subunit PdxT  53.18 
 
 
207 aa  201  8e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.550615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1791  SNO glutamine amidotransferase  52.31 
 
 
201 aa  198  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16453  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12623  glutamine amidotransferase subunit PdxT  51.36 
 
 
198 aa  195  6e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2628  SNO glutamine amidotransferase  50.46 
 
 
210 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.556247  normal  0.566633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3830  glutamine amidotransferase subunit PdxT  55.3 
 
 
195 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3399  SNO glutamine amidotransferase  52.78 
 
 
203 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00144938  hitchhiker  0.00000892885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.93 
 
 
188 aa  188  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200223  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0035  SNO glutamine amidotransferase  47.71 
 
 
196 aa  184  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2041  SNO glutamine amidotransferase  48.42 
 
 
190 aa  182  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0223517  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0573  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.79 
 
 
195 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3807  SNO glutamine amidotransferase  47.2 
 
 
190 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00155051  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.47 
 
 
189 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000532264  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0013  SNO glutamine amidotransferase  45.37 
 
 
193 aa  176  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489468  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0008  SNO glutamine amidotransferase  47.66 
 
 
194 aa  175  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.98 
 
 
188 aa  175  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273171  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0598  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.79 
 
 
195 aa  174  9e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.474532  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_538  SNO glutamine amidotransferase family  46.33 
 
 
195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1897  SNO glutamine amidotransferase  46.26 
 
 
191 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0960589  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.66 
 
 
196 aa  171  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1317  SNO glutamine amidotransferase  44.95 
 
 
204 aa  169  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522409  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19920  pyridoxal phosphate synthase yaaE subunit  47 
 
 
208 aa  168  8e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.573466  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.12 
 
 
196 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000589315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.12 
 
 
196 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000426828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0017  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.12 
 
 
196 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000149279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.12 
 
 
196 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000439429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0015  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.2 
 
 
196 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5303  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.2 
 
 
196 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178442  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3235  SNO glutamine amidotransferase  44.44 
 
 
189 aa  164  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4347  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.74 
 
 
191 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000714565  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.94 
 
 
196 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00056794  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1750  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.86 
 
 
191 aa  162  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.28 
 
 
192 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000128055  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1107  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.86 
 
 
201 aa  162  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00213413  decreased coverage  0.0014311 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3723  SNO glutamine amidotransferase  42.59 
 
 
189 aa  161  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1858  glutamine amidotransferase subunit PdxT  39.91 
 
 
187 aa  160  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0468928  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0448  glutamine amidotransferase subunit PdxT  39.45 
 
 
188 aa  158  6e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000803094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.12 
 
 
196 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000139131  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1037  glutamine amidotransferase  40.37 
 
 
191 aa  156  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133166  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0463  glutamine amidotransferase subunit PdxT  38.99 
 
 
188 aa  156  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0015  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.12 
 
 
196 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0014  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.66 
 
 
196 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.66 
 
 
196 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000347383  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0159  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.64 
 
 
186 aa  155  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7092  predicted protein  43.3 
 
 
216 aa  154  9e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1110  SNO glutamine amidotransferase  43.32 
 
 
198 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00211024  hitchhiker  0.0000000000000181394 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0542  glutamine amidotransferase subunit PdxT  38.46 
 
 
186 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0556  glutamine amidotransferase subunit PdxT  38.46 
 
 
186 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1871  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.18 
 
 
192 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156111  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2184  SNO glutamine amidotransferase  37.61 
 
 
188 aa  149  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000861553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3161  SNO glutamine amidotransferase  42.4 
 
 
191 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.655935  normal  0.065831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2937  SNO glutamine amidotransferase  39.35 
 
 
190 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0527364  normal  0.214935 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0959  SNO glutamine amidotransferase  38.36 
 
 
192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1547  SNO glutamine amidotransferase  41.4 
 
 
195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0627546  hitchhiker  0.00674426 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1060  pyridoxal 5'-phosphate synthase, glutaminase subunit Pdx2  38.36 
 
 
197 aa  144  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.149673 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1859  glutamine amidotransferase subunit PdxT  39.17 
 
 
189 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00060363  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0078  hypothetical protein  41.82 
 
 
189 aa  142  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0431149 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1478  SNO glutamine amidotransferase  36 
 
 
205 aa  142  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1078  glutamine amidotransferase subunit PdxT  37.73 
 
 
199 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000385984  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1638  SNO glutamine amidotransferase  36.44 
 
 
200 aa  141  7e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06141  Putative uncharacterized proteinPyridoxine ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96X05]  37.5 
 
 
271 aa  141  9e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.71661  normal  0.293469 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2240  SNO glutamine amidotransferase  38.25 
 
 
189 aa  141  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0214455  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0040  SNO glutamine amidotransferase  43.56 
 
 
196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0209  SNO glutamine amidotransferase  40.72 
 
 
199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.678757 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0227  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.48 
 
 
204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.550903  normal  0.363772 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0009  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.33 
 
 
199 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1601  SNO glutamine amidotransferase  38.71 
 
 
198 aa  138  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0920  SNO glutamine amidotransferase  39.91 
 
 
186 aa  137  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1483  SNO glutamine amidotransferase  37.21 
 
 
190 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.441099  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1220  SNO glutamine amidotransferase  46.05 
 
 
212 aa  135  5e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.148888  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0902  glutamine amidotransferase subunit PdxT  37.5 
 
 
212 aa  135  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1336  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.18 
 
 
202 aa  131  9e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.424247  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1924  glutamine amidotransferase subunit PdxT  36.73 
 
 
198 aa  131  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10810  pyridoxal phosphate synthase yaaE subunit  39.04 
 
 
191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0268  glutamine amidotransferase subunit PdxT  39.29 
 
 
202 aa  128  6e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0422  glutamine amidotransferase subunit PdxT  36.82 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>