144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1336 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1336  glutamine amidotransferase subunit PdxT  100 
 
 
202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.424247  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0268  glutamine amidotransferase subunit PdxT  89.55 
 
 
202 aa  368  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0227  glutamine amidotransferase subunit PdxT  60.5 
 
 
204 aa  249  2e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.550903  normal  0.363772 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0209  SNO glutamine amidotransferase  56.93 
 
 
199 aa  228  5e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.678757 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1787  SNO glutamine amidotransferase  54.19 
 
 
198 aa  225  4e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.916048  normal  0.392501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1638  SNO glutamine amidotransferase  51.96 
 
 
200 aa  205  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1924  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.73 
 
 
198 aa  189  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3580  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.5 
 
 
200 aa  160  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.118248 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0468  SNO glutamine amidotransferase  45.27 
 
 
192 aa  159  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3235  SNO glutamine amidotransferase  47.03 
 
 
189 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1478  SNO glutamine amidotransferase  40.2 
 
 
205 aa  158  5e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4347  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.57 
 
 
191 aa  157  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000714565  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0422  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45 
 
 
198 aa  154  9e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3723  SNO glutamine amidotransferase  45.54 
 
 
189 aa  154  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2107  SNO glutamine amidotransferase  44.12 
 
 
219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0846545  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0035  SNO glutamine amidotransferase  44.39 
 
 
196 aa  150  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2323  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.39 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0008  SNO glutamine amidotransferase  45.32 
 
 
194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.63 
 
 
188 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273171  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5148  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.69 
 
 
203 aa  144  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00302911  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2382  SNO glutamine amidotransferase  43.56 
 
 
201 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6117  SNO glutamine amidotransferase family  41.5 
 
 
196 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298038  normal  0.336811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3807  SNO glutamine amidotransferase  46.53 
 
 
190 aa  141  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00155051  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1858  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.55 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0468928  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_538  SNO glutamine amidotransferase family  43.63 
 
 
195 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.57 
 
 
188 aa  138  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200223  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3180  SNO glutamine amidotransferase  43.84 
 
 
217 aa  138  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2067  SNO glutamine amidotransferase  42.5 
 
 
196 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1988  SNO glutamine amidotransferase  45.37 
 
 
200 aa  137  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558528 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0009  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.66 
 
 
199 aa  137  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2041  SNO glutamine amidotransferase  42.65 
 
 
190 aa  136  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0223517  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.16 
 
 
196 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.16 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000128055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0448  glutamine amidotransferase subunit PdxT  38.54 
 
 
188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000803094  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0598  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.65 
 
 
195 aa  134  9e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.474532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2109  SNO glutamine amidotransferase  43.06 
 
 
204 aa  133  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0561786  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1367  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.14 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1897  SNO glutamine amidotransferase  41.5 
 
 
191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0960589  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0463  glutamine amidotransferase subunit PdxT  38.05 
 
 
188 aa  132  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2566  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.92 
 
 
195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3058  SNO glutamine amidotransferase  40.98 
 
 
207 aa  132  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293498  normal  0.634434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2305  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.18 
 
 
236 aa  131  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00618121  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0824  SNO glutamine amidotransferase  40.8 
 
 
202 aa  131  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589495  normal  0.0695207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2350  SNO glutamine amidotransferase  40.4 
 
 
204 aa  130  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1439  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2097  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.29 
 
 
201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1317  SNO glutamine amidotransferase  41.21 
 
 
204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522409  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1483  SNO glutamine amidotransferase  37 
 
 
190 aa  129  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.441099  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1930  SNO glutamine amidotransferase  40.95 
 
 
201 aa  129  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142807  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57121  predicted protein  36.21 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.376231  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15360  pyridoxal phosphate synthase yaaE subunit  38.32 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132239  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1750  glutamine amidotransferase subunit PdxT  38.35 
 
 
191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2289  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.67 
 
 
206 aa  128  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0013  SNO glutamine amidotransferase  39.32 
 
 
193 aa  128  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489468  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2250  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.67 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0531826  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1037  glutamine amidotransferase  41.18 
 
 
191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2297  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.67 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1347  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.86 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.550615 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0078  hypothetical protein  38.31 
 
 
189 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0431149 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0573  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.65 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3399  SNO glutamine amidotransferase  40.2 
 
 
203 aa  125  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00144938  hitchhiker  0.00000892885 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1547  SNO glutamine amidotransferase  42.57 
 
 
195 aa  125  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0627546  hitchhiker  0.00674426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2937  SNO glutamine amidotransferase  42.57 
 
 
190 aa  124  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0527364  normal  0.214935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1664  SNO glutamine amidotransferase  41 
 
 
213 aa  124  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0590929  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2628  SNO glutamine amidotransferase  38.31 
 
 
210 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.556247  normal  0.566633 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2184  SNO glutamine amidotransferase  39.5 
 
 
188 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000861553  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.1 
 
 
189 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000532264  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1908  SNO glutamine amidotransferase  38.81 
 
 
188 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0920  SNO glutamine amidotransferase  41.21 
 
 
186 aa  122  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2298  SNO glutamine amidotransferase  37.8 
 
 
211 aa  122  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1060  pyridoxal 5'-phosphate synthase, glutaminase subunit Pdx2  39.39 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.149673 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0959  SNO glutamine amidotransferase  34.31 
 
 
192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2240  SNO glutamine amidotransferase  40.59 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0214455  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1565  SNO glutamine amidotransferase  40.31 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.499168  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1017  glutamine amidotransferase subunit PdxT  37.13 
 
 
187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.538728  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0551  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.88 
 
 
197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2035  glutamine amidotransferase subunit PdxT  37.05 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000103921 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  38.24 
 
 
196 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000439429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  38.73 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000426828  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2227  glutamine amidotransferase subunit PdxT  39.3 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0367546 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0015  glutamine amidotransferase subunit PdxT  37.75 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5303  glutamine amidotransferase subunit PdxT  37.75 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178442  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  38.24 
 
 
196 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000589315  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1409  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.21 
 
 
192 aa  116  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.794168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0017  glutamine amidotransferase subunit PdxT  38.24 
 
 
196 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000149279  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3161  SNO glutamine amidotransferase  41.06 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.655935  normal  0.065831 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0040  SNO glutamine amidotransferase  39.22 
 
 
196 aa  115  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0542  glutamine amidotransferase subunit PdxT  39.5 
 
 
186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12623  glutamine amidotransferase subunit PdxT  39.51 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0556  glutamine amidotransferase subunit PdxT  39.5 
 
 
186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1792  SNO glutamine amidotransferase  37.2 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.369392  normal  0.171036 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3543  SNO glutamine amidotransferase  42.63 
 
 
210 aa  112  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1107  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.68 
 
 
201 aa  112  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00213413  decreased coverage  0.0014311 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7092  predicted protein  35.32 
 
 
216 aa  112  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1859  glutamine amidotransferase subunit PdxT  33.84 
 
 
189 aa  112  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00060363  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0956  glutamine amidotransferase subunit PdxT  36.45 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  37.75 
 
 
196 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000139131  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0015  glutamine amidotransferase subunit PdxT  37.75 
 
 
196 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06141  Putative uncharacterized proteinPyridoxine ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96X05]  43.56 
 
 
271 aa  111  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.71661  normal  0.293469 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  37.75 
 
 
196 aa  111  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000347383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>