126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0227 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0227  glutamine amidotransferase subunit PdxT  100 
 
 
204 aa  403  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.550903  normal  0.363772 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1336  glutamine amidotransferase subunit PdxT  60.5 
 
 
202 aa  249  2e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.424247  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0268  glutamine amidotransferase subunit PdxT  61 
 
 
202 aa  247  7e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1787  SNO glutamine amidotransferase  49.75 
 
 
198 aa  204  9e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.916048  normal  0.392501 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0209  SNO glutamine amidotransferase  54 
 
 
199 aa  203  1e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.678757 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1638  SNO glutamine amidotransferase  47.32 
 
 
200 aa  195  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1924  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.5 
 
 
198 aa  191  5e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1478  SNO glutamine amidotransferase  42.29 
 
 
205 aa  157  8e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.56 
 
 
188 aa  155  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200223  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0468  SNO glutamine amidotransferase  41.8 
 
 
192 aa  155  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2041  SNO glutamine amidotransferase  43.9 
 
 
190 aa  154  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0223517  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3580  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.03 
 
 
200 aa  154  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.118248 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1347  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.26 
 
 
207 aa  150  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.550615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0824  SNO glutamine amidotransferase  44.12 
 
 
202 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589495  normal  0.0695207 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1317  SNO glutamine amidotransferase  46.31 
 
 
204 aa  149  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522409  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2566  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.68 
 
 
195 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0035  SNO glutamine amidotransferase  43.35 
 
 
196 aa  149  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_538  SNO glutamine amidotransferase family  43.35 
 
 
195 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6117  SNO glutamine amidotransferase family  43.94 
 
 
196 aa  148  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298038  normal  0.336811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5148  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.04 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00302911  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_002936  DET0598  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.86 
 
 
195 aa  145  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.474532  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0422  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.44 
 
 
198 aa  145  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3180  SNO glutamine amidotransferase  47.62 
 
 
217 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1897  SNO glutamine amidotransferase  45.54 
 
 
191 aa  145  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0960589  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3723  SNO glutamine amidotransferase  43.07 
 
 
189 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2067  SNO glutamine amidotransferase  43.94 
 
 
196 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3235  SNO glutamine amidotransferase  43.56 
 
 
189 aa  144  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2107  SNO glutamine amidotransferase  46.84 
 
 
219 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0846545  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2097  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.36 
 
 
201 aa  143  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0956  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.8 
 
 
187 aa  143  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2109  SNO glutamine amidotransferase  47.32 
 
 
204 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0561786  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4347  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.38 
 
 
191 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000714565  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0920  SNO glutamine amidotransferase  44.72 
 
 
186 aa  142  5e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1017  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.02 
 
 
187 aa  141  5e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.538728  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2628  SNO glutamine amidotransferase  45 
 
 
210 aa  141  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.556247  normal  0.566633 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1753  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.46 
 
 
187 aa  141  7e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.49529  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0078  hypothetical protein  38.24 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0431149 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0573  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.38 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0928  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.46 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1601  SNO glutamine amidotransferase  44.12 
 
 
198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2305  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.48 
 
 
236 aa  139  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00618121  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2035  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.59 
 
 
236 aa  139  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000103921 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0448  glutamine amidotransferase subunit PdxT  39.41 
 
 
188 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000803094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0463  glutamine amidotransferase subunit PdxT  39.41 
 
 
188 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0015  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.8 
 
 
196 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5303  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.8 
 
 
196 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178442  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1664  SNO glutamine amidotransferase  43.14 
 
 
213 aa  137  8.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0590929  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1367  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.5 
 
 
199 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3807  SNO glutamine amidotransferase  44 
 
 
190 aa  136  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00155051  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2382  SNO glutamine amidotransferase  41.94 
 
 
201 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12623  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.62 
 
 
198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.33 
 
 
196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1988  SNO glutamine amidotransferase  44.88 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2250  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.56 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0531826  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2297  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.56 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2289  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.56 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1439  glutamine amidotransferase subunit PdxT  38.66 
 
 
186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1859  glutamine amidotransferase subunit PdxT  37.81 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00060363  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2937  SNO glutamine amidotransferase  43.07 
 
 
190 aa  132  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0527364  normal  0.214935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2350  SNO glutamine amidotransferase  42.78 
 
 
204 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1792  SNO glutamine amidotransferase  43.75 
 
 
203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.369392  normal  0.171036 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2184  SNO glutamine amidotransferase  38.19 
 
 
188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000861553  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3399  SNO glutamine amidotransferase  43.28 
 
 
203 aa  131  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00144938  hitchhiker  0.00000892885 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2227  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.71 
 
 
195 aa  131  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0367546 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  38.12 
 
 
188 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273171  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1858  glutamine amidotransferase subunit PdxT  37.44 
 
 
187 aa  131  9e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0468928  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1037  glutamine amidotransferase  39.3 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.74 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000426828  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1750  glutamine amidotransferase subunit PdxT  35.96 
 
 
191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.74 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000439429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.74 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000128055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.74 
 
 
196 aa  129  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000589315  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0009  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.41 
 
 
199 aa  129  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0017  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.74 
 
 
196 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000149279  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57121  predicted protein  35.32 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.376231  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2240  SNO glutamine amidotransferase  39.22 
 
 
189 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0214455  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.57 
 
 
189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000532264  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0008  SNO glutamine amidotransferase  38.73 
 
 
194 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.74 
 
 
196 aa  128  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000139131  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0959  SNO glutamine amidotransferase  39.5 
 
 
192 aa  128  6e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0015  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.74 
 
 
196 aa  128  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0013  SNO glutamine amidotransferase  39.51 
 
 
193 aa  128  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0014  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.21 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.21 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000347383  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2323  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.64 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1908  SNO glutamine amidotransferase  37.7 
 
 
188 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0159  glutamine amidotransferase subunit PdxT  39.15 
 
 
186 aa  126  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2298  SNO glutamine amidotransferase  43.3 
 
 
211 aa  125  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1930  SNO glutamine amidotransferase  42.16 
 
 
201 aa  125  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142807  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0542  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.21 
 
 
186 aa  124  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0556  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.21 
 
 
186 aa  124  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0370  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.79 
 
 
197 aa  124  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46 
 
 
192 aa  123  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3058  SNO glutamine amidotransferase  42.93 
 
 
207 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293498  normal  0.634434 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15360  pyridoxal phosphate synthase yaaE subunit  40 
 
 
212 aa  122  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132239  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3830  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.03 
 
 
195 aa  121  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7092  predicted protein  37.56 
 
 
216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1409  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.92 
 
 
192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.794168  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0551  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.8 
 
 
197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  38.05 
 
 
196 aa  119  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00056794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>