125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0209 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0209  SNO glutamine amidotransferase  100 
 
 
199 aa  399  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.678757 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1336  glutamine amidotransferase subunit PdxT  56.93 
 
 
202 aa  228  4e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.424247  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0268  glutamine amidotransferase subunit PdxT  57.21 
 
 
202 aa  223  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0227  glutamine amidotransferase subunit PdxT  54 
 
 
204 aa  203  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.550903  normal  0.363772 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1787  SNO glutamine amidotransferase  50.76 
 
 
198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.916048  normal  0.392501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1638  SNO glutamine amidotransferase  45.1 
 
 
200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3580  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.73 
 
 
200 aa  161  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.118248 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1478  SNO glutamine amidotransferase  42.03 
 
 
205 aa  158  5e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0422  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.73 
 
 
198 aa  157  9e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1924  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.69 
 
 
198 aa  157  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2041  SNO glutamine amidotransferase  44.12 
 
 
190 aa  155  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0223517  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5148  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.26 
 
 
203 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00302911  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1367  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.74 
 
 
199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0035  SNO glutamine amidotransferase  45.59 
 
 
196 aa  150  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0468  SNO glutamine amidotransferase  43.39 
 
 
192 aa  150  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3807  SNO glutamine amidotransferase  47.5 
 
 
190 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00155051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2323  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.31 
 
 
196 aa  148  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1347  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.56 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.550615 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0920  SNO glutamine amidotransferase  46.46 
 
 
186 aa  145  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1439  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.71 
 
 
186 aa  145  5e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1037  glutamine amidotransferase  44.55 
 
 
191 aa  143  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133166  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3235  SNO glutamine amidotransferase  44 
 
 
189 aa  143  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_538  SNO glutamine amidotransferase family  45.85 
 
 
195 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0573  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.59 
 
 
195 aa  143  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1858  glutamine amidotransferase subunit PdxT  39.9 
 
 
187 aa  142  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0468928  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2067  SNO glutamine amidotransferase  46.7 
 
 
196 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0598  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.85 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.474532  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2305  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.72 
 
 
236 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00618121  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2097  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.05 
 
 
201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.72 
 
 
196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0824  SNO glutamine amidotransferase  43.72 
 
 
202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589495  normal  0.0695207 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0448  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.65 
 
 
188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000803094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0463  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.65 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.69 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000128055  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0013  SNO glutamine amidotransferase  42.65 
 
 
193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489468  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0370  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.88 
 
 
197 aa  139  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3399  SNO glutamine amidotransferase  44.92 
 
 
203 aa  139  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00144938  hitchhiker  0.00000892885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.29 
 
 
188 aa  139  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200223  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0542  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.38 
 
 
186 aa  137  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0556  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.38 
 
 
186 aa  137  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2107  SNO glutamine amidotransferase  43.41 
 
 
219 aa  137  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0846545  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1547  SNO glutamine amidotransferase  44.21 
 
 
195 aa  137  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0627546  hitchhiker  0.00674426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1317  SNO glutamine amidotransferase  43.5 
 
 
204 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522409  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1750  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.5 
 
 
191 aa  137  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2382  SNO glutamine amidotransferase  45.16 
 
 
201 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0009  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.28 
 
 
199 aa  136  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1565  SNO glutamine amidotransferase  44.5 
 
 
206 aa  136  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.499168  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0956  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.25 
 
 
187 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0551  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.33 
 
 
197 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.29 
 
 
196 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000589315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.78 
 
 
196 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000439429  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42 
 
 
189 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000532264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0017  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.29 
 
 
196 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000149279  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2035  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.27 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000103921 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.29 
 
 
196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000426828  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1930  SNO glutamine amidotransferase  43.52 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142807  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0008  SNO glutamine amidotransferase  40 
 
 
194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6117  SNO glutamine amidotransferase family  42.64 
 
 
196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298038  normal  0.336811 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0159  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.94 
 
 
186 aa  132  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2566  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.09 
 
 
195 aa  132  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1017  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.93 
 
 
187 aa  132  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.538728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4347  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.14 
 
 
191 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000714565  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3180  SNO glutamine amidotransferase  43.62 
 
 
217 aa  131  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1664  SNO glutamine amidotransferase  43.41 
 
 
213 aa  131  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0590929  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2628  SNO glutamine amidotransferase  43.62 
 
 
210 aa  131  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.556247  normal  0.566633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2109  SNO glutamine amidotransferase  45.83 
 
 
204 aa  131  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0561786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3723  SNO glutamine amidotransferase  41.5 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2298  SNO glutamine amidotransferase  42.31 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2184  SNO glutamine amidotransferase  40.8 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000861553  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1107  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.32 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00213413  decreased coverage  0.0014311 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.65 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5303  glutamine amidotransferase subunit PdxT  39.81 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178442  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1897  SNO glutamine amidotransferase  41.21 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0960589  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3058  SNO glutamine amidotransferase  41.5 
 
 
207 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293498  normal  0.634434 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0015  glutamine amidotransferase subunit PdxT  39.81 
 
 
196 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1409  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.09 
 
 
192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.794168  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1988  SNO glutamine amidotransferase  41.38 
 
 
200 aa  128  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558528 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0928  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.32 
 
 
187 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57121  predicted protein  37.39 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.376231  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1753  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.25 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.49529  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  39.32 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00056794  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1792  SNO glutamine amidotransferase  42.71 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.369392  normal  0.171036 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2227  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.47 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0367546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2350  SNO glutamine amidotransferase  42.47 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.32 
 
 
192 aa  125  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15360  pyridoxal phosphate synthase yaaE subunit  41 
 
 
212 aa  126  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132239  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2240  SNO glutamine amidotransferase  42.08 
 
 
189 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0214455  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1859  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.91 
 
 
189 aa  125  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00060363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3543  SNO glutamine amidotransferase  44.56 
 
 
210 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2937  SNO glutamine amidotransferase  40.53 
 
 
190 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0527364  normal  0.214935 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.29 
 
 
196 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000139131  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0015  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.29 
 
 
196 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1483  SNO glutamine amidotransferase  38.92 
 
 
190 aa  121  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.441099  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1871  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.22 
 
 
192 aa  121  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156111  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0014  glutamine amidotransferase subunit PdxT  39.81 
 
 
196 aa  121  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  39.81 
 
 
196 aa  121  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000347383  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1908  SNO glutamine amidotransferase  39.9 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19920  pyridoxal phosphate synthase yaaE subunit  40.19 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.573466  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0959  SNO glutamine amidotransferase  38.42 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0078  hypothetical protein  39.2 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0431149 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>