170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1791 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1791  SNO glutamine amidotransferase  100 
 
 
201 aa  397  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16453  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1778  SNO glutamine amidotransferase  92.04 
 
 
201 aa  348  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2109  SNO glutamine amidotransferase  64.82 
 
 
204 aa  254  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0561786  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3180  SNO glutamine amidotransferase  64.1 
 
 
217 aa  250  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3058  SNO glutamine amidotransferase  64.65 
 
 
207 aa  244  9e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293498  normal  0.634434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2628  SNO glutamine amidotransferase  62.94 
 
 
210 aa  242  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.556247  normal  0.566633 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2107  SNO glutamine amidotransferase  62.81 
 
 
219 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0846545  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0824  SNO glutamine amidotransferase  63.32 
 
 
202 aa  240  7.999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589495  normal  0.0695207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2382  SNO glutamine amidotransferase  61.22 
 
 
201 aa  240  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15360  pyridoxal phosphate synthase yaaE subunit  61.14 
 
 
212 aa  239  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132239  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2298  SNO glutamine amidotransferase  62.81 
 
 
211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3399  SNO glutamine amidotransferase  61.86 
 
 
203 aa  238  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00144938  hitchhiker  0.00000892885 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2097  glutamine amidotransferase subunit PdxT  63.27 
 
 
201 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2350  SNO glutamine amidotransferase  62.56 
 
 
204 aa  236  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2067  SNO glutamine amidotransferase  65.31 
 
 
196 aa  231  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5148  glutamine amidotransferase subunit PdxT  60.2 
 
 
203 aa  231  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00302911  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1988  SNO glutamine amidotransferase  60.61 
 
 
200 aa  229  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1930  SNO glutamine amidotransferase  62.05 
 
 
201 aa  229  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142807  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2250  glutamine amidotransferase subunit PdxT  61.22 
 
 
206 aa  228  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0531826  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2297  glutamine amidotransferase subunit PdxT  61.22 
 
 
206 aa  228  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1347  glutamine amidotransferase subunit PdxT  64.29 
 
 
207 aa  228  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.550615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6117  SNO glutamine amidotransferase family  62.76 
 
 
196 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298038  normal  0.336811 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1367  glutamine amidotransferase subunit PdxT  59 
 
 
199 aa  226  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1792  SNO glutamine amidotransferase  58.21 
 
 
203 aa  226  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.369392  normal  0.171036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2289  glutamine amidotransferase subunit PdxT  60.71 
 
 
206 aa  225  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2566  glutamine amidotransferase subunit PdxT  61.22 
 
 
195 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1664  SNO glutamine amidotransferase  55.45 
 
 
213 aa  218  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0590929  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2035  glutamine amidotransferase subunit PdxT  55.09 
 
 
236 aa  217  7.999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000103921 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12623  glutamine amidotransferase subunit PdxT  58.13 
 
 
198 aa  214  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2305  glutamine amidotransferase subunit PdxT  52.31 
 
 
236 aa  205  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00618121  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3830  glutamine amidotransferase subunit PdxT  60.2 
 
 
195 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0573  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.78 
 
 
195 aa  195  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3235  SNO glutamine amidotransferase  50.79 
 
 
189 aa  189  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1897  SNO glutamine amidotransferase  51.31 
 
 
191 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0960589  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0598  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.74 
 
 
195 aa  186  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.474532  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1110  SNO glutamine amidotransferase  52.33 
 
 
198 aa  186  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00211024  hitchhiker  0.0000000000000181394 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_538  SNO glutamine amidotransferase family  50.26 
 
 
195 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0035  SNO glutamine amidotransferase  51.3 
 
 
196 aa  185  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0008  SNO glutamine amidotransferase  50.77 
 
 
194 aa  185  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3807  SNO glutamine amidotransferase  50 
 
 
190 aa  185  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00155051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.26 
 
 
196 aa  184  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000589315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.26 
 
 
196 aa  184  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000426828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0017  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.26 
 
 
196 aa  184  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000149279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.26 
 
 
196 aa  184  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4347  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.41 
 
 
191 aa  184  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000714565  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.88 
 
 
188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273171  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3723  SNO glutamine amidotransferase  47.4 
 
 
189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0013  SNO glutamine amidotransferase  48.98 
 
 
193 aa  182  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489468  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0448  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.08 
 
 
188 aa  182  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000803094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0463  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.08 
 
 
188 aa  182  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.26 
 
 
196 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000439429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0015  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.23 
 
 
196 aa  180  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5303  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.23 
 
 
196 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178442  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2937  SNO glutamine amidotransferase  48.44 
 
 
190 aa  178  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0527364  normal  0.214935 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.21 
 
 
192 aa  177  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000128055  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.35 
 
 
188 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200223  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.69 
 
 
196 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00056794  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1858  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.6 
 
 
187 aa  175  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0468928  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1859  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.63 
 
 
189 aa  175  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00060363  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.26 
 
 
196 aa  175  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000139131  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0015  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.26 
 
 
196 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0014  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.74 
 
 
196 aa  174  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.74 
 
 
196 aa  174  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000347383  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1220  SNO glutamine amidotransferase  54.21 
 
 
212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.148888  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1478  SNO glutamine amidotransferase  44.55 
 
 
205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1750  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.6 
 
 
191 aa  171  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2041  SNO glutamine amidotransferase  47.42 
 
 
190 aa  170  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0223517  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.92 
 
 
189 aa  170  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000532264  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0959  SNO glutamine amidotransferase  43.59 
 
 
192 aa  169  3e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1107  glutamine amidotransferase subunit PdxT  49.24 
 
 
201 aa  169  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00213413  decreased coverage  0.0014311 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0159  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.5 
 
 
186 aa  167  9e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19920  pyridoxal phosphate synthase yaaE subunit  46.38 
 
 
208 aa  167  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.573466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0542  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.37 
 
 
186 aa  165  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0556  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.37 
 
 
186 aa  165  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1037  glutamine amidotransferase  44.04 
 
 
191 aa  160  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133166  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2184  SNO glutamine amidotransferase  40.93 
 
 
188 aa  159  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000861553  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0920  SNO glutamine amidotransferase  47.89 
 
 
186 aa  158  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3161  SNO glutamine amidotransferase  46.67 
 
 
191 aa  157  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.655935  normal  0.065831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1317  SNO glutamine amidotransferase  47.37 
 
 
204 aa  156  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522409  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1547  SNO glutamine amidotransferase  46.07 
 
 
195 aa  155  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0627546  hitchhiker  0.00674426 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2240  SNO glutamine amidotransferase  40.62 
 
 
189 aa  154  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0214455  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0422  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.59 
 
 
198 aa  150  8e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1060  pyridoxal 5'-phosphate synthase, glutaminase subunit Pdx2  42.86 
 
 
197 aa  150  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.149673 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1483  SNO glutamine amidotransferase  37.77 
 
 
190 aa  149  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.441099  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1638  SNO glutamine amidotransferase  40.1 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0902  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.93 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0370  glutamine amidotransferase subunit PdxT  48.21 
 
 
197 aa  146  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1871  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.9 
 
 
192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156111  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3479  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.35 
 
 
195 aa  143  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.31232  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1601  SNO glutamine amidotransferase  40.59 
 
 
198 aa  143  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0551  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.13 
 
 
197 aa  143  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0040  SNO glutamine amidotransferase  46.11 
 
 
196 aa  143  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0009  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.43 
 
 
199 aa  142  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1078  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.36 
 
 
199 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000385984  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7092  predicted protein  42.99 
 
 
216 aa  140  9e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.67 
 
 
192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1565  SNO glutamine amidotransferase  43.94 
 
 
206 aa  138  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.499168  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2227  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.95 
 
 
195 aa  137  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0367546 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0078  hypothetical protein  41.45 
 
 
189 aa  136  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0431149 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10810  pyridoxal phosphate synthase yaaE subunit  42.56 
 
 
191 aa  135  4e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>