More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0971 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0971  ferrous iron transport protein B  100 
 
 
886 aa  1799    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000273145  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0571  ferrous iron transport protein B  50.56 
 
 
845 aa  834    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237546  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12990  ferrous iron transporter FeoB  46.46 
 
 
824 aa  693    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0255803  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20050  ferrous iron transporter FeoB  52.27 
 
 
749 aa  431  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.558981  normal  0.661098 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  51.68 
 
 
714 aa  422  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  53.1 
 
 
715 aa  416  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  47.36 
 
 
721 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  47.81 
 
 
753 aa  372  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  44.39 
 
 
716 aa  358  2.9999999999999997e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  44.26 
 
 
712 aa  347  4e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0286  Fe2+ transport system protein B  45.72 
 
 
704 aa  347  7e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  45.17 
 
 
691 aa  344  5e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  39.42 
 
 
680 aa  273  9e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  39.08 
 
 
680 aa  266  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  40.16 
 
 
784 aa  262  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  38.38 
 
 
676 aa  258  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  37.3 
 
 
631 aa  255  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  31.31 
 
 
697 aa  253  8.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  38.67 
 
 
662 aa  253  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  39.36 
 
 
662 aa  253  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  39.36 
 
 
662 aa  253  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  39.1 
 
 
662 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  39.36 
 
 
662 aa  251  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  39.08 
 
 
662 aa  251  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  39.1 
 
 
662 aa  251  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  39.1 
 
 
662 aa  251  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  38.93 
 
 
662 aa  251  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  38.67 
 
 
662 aa  250  9e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  38.76 
 
 
631 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  35.14 
 
 
743 aa  243  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  38.56 
 
 
662 aa  243  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  36.53 
 
 
664 aa  242  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  36.53 
 
 
664 aa  242  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  38.63 
 
 
665 aa  241  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  36.98 
 
 
848 aa  239  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  37.98 
 
 
664 aa  240  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  34.38 
 
 
669 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  35.28 
 
 
666 aa  236  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  35.44 
 
 
669 aa  236  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  37.92 
 
 
662 aa  235  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  33.88 
 
 
587 aa  235  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  33.33 
 
 
587 aa  235  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  36.86 
 
 
668 aa  234  5e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  37.09 
 
 
785 aa  231  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  35.99 
 
 
713 aa  231  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  34.31 
 
 
741 aa  231  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  36.49 
 
 
688 aa  230  7e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  40.79 
 
 
740 aa  228  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  40.52 
 
 
676 aa  226  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  34.75 
 
 
747 aa  226  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  31.99 
 
 
664 aa  226  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  42.05 
 
 
712 aa  225  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  40.58 
 
 
711 aa  225  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0976  ferrous iron transport protein B  38.1 
 
 
676 aa  225  3e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00114707  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  41.2 
 
 
741 aa  224  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  41.86 
 
 
712 aa  223  9e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0901  ferrous iron transport protein B  34.33 
 
 
708 aa  223  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000608812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  39.53 
 
 
770 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  35.53 
 
 
684 aa  221  6e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  40.13 
 
 
740 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  35.43 
 
 
728 aa  220  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  41.95 
 
 
712 aa  219  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  38.44 
 
 
776 aa  218  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  32.39 
 
 
724 aa  218  5e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  39.37 
 
 
712 aa  217  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  43 
 
 
738 aa  217  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  33.97 
 
 
844 aa  216  1.9999999999999998e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  38.72 
 
 
665 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  37.81 
 
 
712 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  34.11 
 
 
829 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0283  ferrous iron transport protein B  33.25 
 
 
674 aa  214  5.999999999999999e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1761  ferrous iron transport protein B  35.68 
 
 
711 aa  214  5.999999999999999e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  39.53 
 
 
770 aa  214  7e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  33.7 
 
 
667 aa  214  7e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  33.7 
 
 
669 aa  214  7.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  35.53 
 
 
666 aa  212  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  33.15 
 
 
628 aa  211  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  38.36 
 
 
786 aa  211  4e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1973  ferrous iron transport protein B  32.99 
 
 
718 aa  211  4e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  37.64 
 
 
649 aa  210  7e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0012  ferrous iron transport protein B  33.07 
 
 
717 aa  210  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00299021  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  37.94 
 
 
713 aa  209  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  33.52 
 
 
716 aa  206  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2493  ferrous iron transport protein B  36.28 
 
 
743 aa  206  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9646  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  39.02 
 
 
778 aa  205  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  35.82 
 
 
665 aa  206  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  36.97 
 
 
786 aa  205  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0441  ferrous iron transport protein B  33.79 
 
 
700 aa  203  9e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0894  ferrous iron transport protein B  32.58 
 
 
741 aa  203  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.828262 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1015  ferrous iron transport protein B  37.08 
 
 
759 aa  202  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.913336 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2669  ferrous iron transport protein B  36.59 
 
 
725 aa  202  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1553  small GTP-binding protein  37.87 
 
 
822 aa  202  3e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00130117  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  36.45 
 
 
783 aa  201  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  31.85 
 
 
669 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  37.24 
 
 
725 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1397  ferrous iron transport protein B  34.22 
 
 
369 aa  199  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.10976  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0555  ferrous iron transport B domain-containing protein  33.33 
 
 
577 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0239  ferrous iron transport protein B  36.61 
 
 
816 aa  198  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  38.51 
 
 
778 aa  198  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1959  ferrous iron transport protein B  36.61 
 
 
816 aa  198  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>