36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_R0008 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_R0008  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.137001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0003  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0018  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25080  tRNA-Glu  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0035  tRNA-Glu  85.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000239381  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0052  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662201 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0019  tRNA-Glu  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00210704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0030  tRNA-Glu  85.94 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000166149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0030  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0242042  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06180  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.75789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0032  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00151707  hitchhiker  0.000680514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0029  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  hitchhiker  0.000705455 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0027  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.624035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0058  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000216318  unclonable  0.00000608893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0011  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000477421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0050  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0391  tRNA-Glu  85 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0007  tRNA-Glu  84.38 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866877  hitchhiker  0.000537745 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0023  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0002  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0024  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.574829  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0001  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0190537  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0077  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0030  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000352546  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0077  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0030  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000403372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0001  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0056  tRNA-Glu  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37130  tRNA-Glu  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.179999  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0084  tRNA-Glu  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0007  tRNA-Glu  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0027  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0055  tRNA-Glu  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>