41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0162 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0162  protein of unknown function DUF883 ElaB  100 
 
 
108 aa  221  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.28952 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1394  protein of unknown function DUF883, ElaB  31.58 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2572  protein of unknown function DUF883 ElaB  36.46 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459799  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0780  protein of unknown function DUF883 ElaB  35.42 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558861  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0811  protein of unknown function DUF883, ElaB  35.42 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865476  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3904  protein of unknown function DUF883, ElaB  35.42 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0328  protein of unknown function DUF883, ElaB  35.42 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1647  protein of unknown function DUF883 ElaB  51.22 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266219  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0774  protein of unknown function DUF883 ElaB  36.46 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3906  hypothetical protein  36.46 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1624  protein of unknown function DUF883 ElaB  35.21 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0709  protein of unknown function DUF883 ElaB  34.38 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991967  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2440  protein of unknown function DUF883 ElaB  35.42 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0175946  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0692  protein of unknown function DUF883, ElaB  34.38 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143345  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1387  hypothetical protein  35.42 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2067  hypothetical protein  35.42 
 
 
100 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58062  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3240  transmembrane protein  35.42 
 
 
100 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0843  hypothetical protein  35.42 
 
 
100 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.892742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1933  hypothetical protein  35.42 
 
 
100 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650648  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2676  hypothetical protein  35.42 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.470235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3187  hypothetical protein  35.42 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3225  hypothetical protein  35.42 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3634  protein of unknown function DUF883, ElaB  32.39 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.889919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24770  hypothetical protein  40.74 
 
 
109 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2098  hypothetical protein  40.74 
 
 
109 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0675  protein of unknown function DUF883 ElaB  34.78 
 
 
103 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2105  hypothetical protein  32.39 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178666  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3174  hypothetical protein  46.34 
 
 
105 aa  43.9  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.200573  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3039  hypothetical protein  46.34 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000238513  normal  0.059368 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0878  protein of unknown function DUF883, ElaB  41.46 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255055  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3969  vesicle-fusing ATPase  51.16 
 
 
104 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2334  hypothetical protein  44.93 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666966  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2118  hypothetical protein  44.93 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.365861  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2568  hypothetical protein  43.9 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4252  protein of unknown function DUF883 ElaB  47.37 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  32.47 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4183  hypothetical protein  34.72 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.438494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2485  hypothetical protein  50 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28490  hypothetical protein  44.44 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  32.47 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3430  protein of unknown function DUF883 ElaB  37.5 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468728  normal  0.845748 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>