15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3563 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3563  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 307 aa  599  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2648  aminoglycoside phosphotransferase  35.06 
 
 		 328 aa  139  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.691682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2276  aminoglycoside phosphotransferase  36.64 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2013  aminoglycoside phosphotransferase  33.75 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1247  hypothetical protein  53.47 
 
 		 351 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232923 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0179  aminoglycoside phosphotransferase  24.89 
 
 		 334 aa  49.3  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  31.98 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1992  hypothetical protein  30.77 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1721  aminoglycoside phosphotransferase  29.22 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.496446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4092  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01523  hypothetical protein  35.94 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003999  hypothetical protein  31.65 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2109  aminoglycoside phosphotransferase  23.56 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 		 378 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 		 378 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>