22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1721 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1721  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
335 aa  671    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.496446  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1448  spectinomycin phosphotransferase  31.4 
 
 
332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1535  spectinomycin phosphotransferase  32.01 
 
 
330 aa  169  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3855  aminoglycoside phosphotransferase  28 
 
 
334 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000520845  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5845  aminoglycoside phosphotransferase  28.08 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0389  serine/threonine protein kinase  32.72 
 
 
324 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.87305  normal  0.288216 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4843  serine/threonine protein kinase  31.19 
 
 
324 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000540722  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0359  serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 
335 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518063  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0385  serine/threonine protein kinase  33 
 
 
324 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000846832  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2276  aminoglycoside phosphotransferase  28.2 
 
 
325 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2663  aminoglycoside phosphotransferase  28.23 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000329487  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2750  aminoglycoside phosphotransferase  33.62 
 
 
261 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000713701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2661  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
303 aa  46.2  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1083  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  21.32 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  30.9 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2860  aminoglycoside phosphotransferase  29.52 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4092  serine/threonine protein kinase  27.98 
 
 
324 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06330  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000269191  normal  0.792166 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1577  hypothetical protein  21.29 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0327  aminoglycoside phosphotransferase  29.37 
 
 
274 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0179  aminoglycoside phosphotransferase  22.11 
 
 
334 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4697  serine/threonine protein kinase  26.34 
 
 
324 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>