23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2797 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2797  protein of unknown function DUF322  100 
 
 
137 aa  258  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.341039  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4685  protein of unknown function DUF322  42.16 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3258  protein of unknown function DUF322  40.71 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4776  hypothetical protein  41.18 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.407299  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27150  hypothetical protein  35.25 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.311733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4997  hypothetical protein  32.48 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2628  protein of unknown function DUF322  38.05 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000769408  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  36.43 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0407  hypothetical protein  37.31 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3351  protein of unknown function DUF322  34.51 
 
 
166 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2233  hypothetical protein  32.39 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.340857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2280  hypothetical protein  32.39 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347152  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8030  hypothetical protein  44.83 
 
 
157 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  26.67 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2272  hypothetical protein  32.39 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501801  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2964  hypothetical protein  27.91 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.722769  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0416  hypothetical protein  41.82 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0290  protein of unknown function DUF322  29.41 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.502178  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0617  protein of unknown function DUF322  35.45 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.208416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  33.91 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06270  hypothetical protein  28.44 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000136905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1595  protein of unknown function DUF322  33.33 
 
 
168 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521971  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1598  protein of unknown function DUF322  41.07 
 
 
161 aa  40.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>