22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4997 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4997  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  265  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4776  hypothetical protein  41.35 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.407299  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4685  protein of unknown function DUF322  43.43 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8030  hypothetical protein  43.93 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27150  hypothetical protein  30.77 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.311733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0416  hypothetical protein  35.16 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3258  protein of unknown function DUF322  29.84 
 
 
178 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2797  protein of unknown function DUF322  32.48 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.341039  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4681  protein of unknown function DUF322  32.17 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593133  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1782  alkaline shock protein 23  27.1 
 
 
166 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.369118  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2213  alkaline shock protein 23  26.13 
 
 
169 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4348  hypothetical protein  29.77 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0313929  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2252  alkaline shock protein 23  26.13 
 
 
169 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.795316  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2097  protein of unknown function DUF322  28.18 
 
 
201 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000127517  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2794  protein of unknown function DUF322  29.23 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4774  protein of unknown function DUF322  30 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18923  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0413  protein of unknown function DUF322  26.15 
 
 
159 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3348  hypothetical protein  33.03 
 
 
173 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0778  hypothetical protein  40 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.357095  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  24.35 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1595  protein of unknown function DUF322  29.6 
 
 
168 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521971  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2628  protein of unknown function DUF322  30.09 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000769408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>