12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27150 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_27150  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  261  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.311733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2797  protein of unknown function DUF322  34.26 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.341039  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4997  hypothetical protein  30.77 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3376  hypothetical protein  33.64 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.257486  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4776  hypothetical protein  32.11 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.407299  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0416  hypothetical protein  39.36 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3348  hypothetical protein  33.64 
 
 
173 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10090  hypothetical protein  24.14 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.10411e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2794  protein of unknown function DUF322  32.74 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0778  hypothetical protein  36.23 
 
 
157 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.357095  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4685  protein of unknown function DUF322  33 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8030  hypothetical protein  36.07 
 
 
157 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>