22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3348 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3348  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  337  5e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0290  protein of unknown function DUF322  32.76 
 
 		 158 aa  50.8  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.502178  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  49.3  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.311733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4685  protein of unknown function DUF322  37.14 
 
 		 137 aa  48.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4997  hypothetical protein  33.63 
 
 		 134 aa  48.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  30.97 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2233  hypothetical protein  28.46 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.340857  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2272  hypothetical protein  28.46 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2270  hypothetical protein  31.54 
 
 		 126 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2280  hypothetical protein  28.46 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2277  hypothetical protein  31.54 
 
 		 126 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2231  hypothetical protein  31.54 
 
 		 126 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0138018  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4068  hypothetical protein  30.51 
 
 		 258 aa  44.3  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3467  protein of unknown function DUF322  31.43 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.865658 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2326  protein of unknown function DUF322  27.5 
 
 		 131 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000599295  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0273  protein of unknown function DUF322  27.61 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1108  protein of unknown function DUF322  27.18 
 
 		 130 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  32.61 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1464  protein of unknown function DUF322  24.47 
 
 		 150 aa  41.6  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  25.21 
 
 		 134 aa  42  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8027  hypothetical protein  30 
 
 		 165 aa  40.8  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1783  protein of unknown function DUF322  32.67 
 
 		 148 aa  41.2  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>