25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4685 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4685  protein of unknown function DUF322  100 
 
 
137 aa  256  6e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4997  hypothetical protein  41.94 
 
 
134 aa  82  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2797  protein of unknown function DUF322  41.75 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.341039  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27150  hypothetical protein  32.46 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.311733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4776  hypothetical protein  35.45 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.407299  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3348  hypothetical protein  38.32 
 
 
173 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06270  hypothetical protein  28.83 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000136905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1108  protein of unknown function DUF322  28.44 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124117  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3506  protein of unknown function DUF322  32.41 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000443338  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0416  hypothetical protein  30.53 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1523  hypothetical protein  30.28 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000646424  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8030  hypothetical protein  41.51 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0837  hypothetical protein  28.57 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000105699  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1793  alkaline shock protein  26.85 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0585534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2079  alkaline shock protein  26.85 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102163  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  27.64 
 
 
134 aa  41.2  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3258  protein of unknown function DUF322  25.66 
 
 
178 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0273  protein of unknown function DUF322  28.57 
 
 
170 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2252  alkaline shock protein 23  24.58 
 
 
169 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.795316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2213  alkaline shock protein 23  24.58 
 
 
169 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  33.03 
 
 
155 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0057  hypothetical protein  24.19 
 
 
189 aa  40.4  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2270  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2277  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2231  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0138018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>