34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8030 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8030  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  296  9e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4997  hypothetical protein  46.02 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4776  hypothetical protein  40.91 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.407299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0416  hypothetical protein  41.67 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4348  hypothetical protein  33.1 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0313929  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4681  protein of unknown function DUF322  33.87 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2797  protein of unknown function DUF322  41.51 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.341039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8027  hypothetical protein  35.59 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  32.73 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3376  hypothetical protein  36.45 
 
 		 100 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.257486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2794  protein of unknown function DUF322  32.52 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  32.35 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27150  hypothetical protein  30.36 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.311733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3957  hypothetical protein  32.76 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0774  hypothetical protein  32.76 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.28582  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0290  protein of unknown function DUF322  30.53 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.502178  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2628  protein of unknown function DUF322  33.03 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000769408  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1595  protein of unknown function DUF322  31.93 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2097  protein of unknown function DUF322  33.67 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000127517  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3467  protein of unknown function DUF322  31.45 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.865658 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1617  hypothetical protein  28.7 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.109012  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0778  hypothetical protein  44.64 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.357095  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1793  alkaline shock protein  27.35 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0585534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2079  alkaline shock protein  27.35 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102163  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3258  protein of unknown function DUF322  34.17 
 
 		 178 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2272  hypothetical protein  31.36 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4685  protein of unknown function DUF322  34.41 
 
 		 137 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2280  hypothetical protein  31.36 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0413  protein of unknown function DUF322  33.62 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2233  hypothetical protein  31.36 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.340857  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27170  hypothetical protein  35.4 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.730577  normal  0.440149 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0697  hypothetical protein  28.38 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0226225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2964  hypothetical protein  42.22 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.722769  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4774  protein of unknown function DUF322  32.81 
 
 		 167 aa  40.4  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>