19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2547 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2547  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  746    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0821  hypothetical protein  34.38 
 
 		 425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3172  hypothetical protein  33.09 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.532877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2627  hypothetical protein  32.91 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5805  peptidase, S1E (streptogrisin A) subfamily  26.02 
 
 		 374 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  28.24 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.18 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4515  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.37 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0335182  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0484  streptogrisin C. Serine peptidase. MEROPS family S01A  32.4 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  27.3 
 
 		 496 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1566  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.2 
 
 		 380 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0022  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.53 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1324  hypothetical protein  28.51 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0511  hypothetical protein  30.27 
 
 		 434 aa  47  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  27.08 
 
 		 488 aa  47  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1493  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.26 
 
 		 381 aa  46.6  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.03081 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  31.29 
 
 		 522 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0149  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.65 
 
 		 227 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5591  hypothetical protein  28 
 
 		 304 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>