15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2217 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2217  hypothetical protein  100 
 
 		 587 aa  1192    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00749141  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0377  hypothetical protein  49.74 
 
 		 573 aa  548  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.133531  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4455  hypothetical protein  48.22 
 
 		 573 aa  536  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.169873  hitchhiker  0.00310728 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0996  hypothetical protein  35.74 
 
 		 579 aa  361  3e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0718  hypothetical protein  34.56 
 
 		 578 aa  347  3e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0594  hypothetical protein  36.45 
 
 		 580 aa  339  8e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.179265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1048  hypothetical protein  26.82 
 
 		 613 aa  127  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242221  hitchhiker  0.000104388 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0120  hypothetical protein  22.95 
 
 		 598 aa  92  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.321419  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0137  hypothetical protein  23.43 
 
 		 575 aa  87.8  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1576  hypothetical protein  22.93 
 
 		 575 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0956  Protein of unknown function DUF2326  23.05 
 
 		 596 aa  64.7  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.178488  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4575  hypothetical protein  20.68 
 
 		 591 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000245831  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1730  hypothetical protein  22.66 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1466  ATPase  23.05 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0353535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4364  hypothetical protein  21.91 
 
 		 570 aa  51.6  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>