15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0594 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0594  hypothetical protein  100 
 
 
580 aa  1162    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.179265  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0996  hypothetical protein  52.06 
 
 
579 aa  550  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0718  hypothetical protein  50.17 
 
 
578 aa  542  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2217  hypothetical protein  35.8 
 
 
587 aa  352  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00749141  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0377  hypothetical protein  34.87 
 
 
573 aa  335  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.133531  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4455  hypothetical protein  33.85 
 
 
573 aa  326  7e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.169873  hitchhiker  0.00310728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1048  hypothetical protein  26.8 
 
 
613 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242221  hitchhiker  0.000104388 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0120  hypothetical protein  25.21 
 
 
598 aa  84.7  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.321419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0956  Protein of unknown function DUF2326  24.59 
 
 
596 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.178488  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0137  hypothetical protein  25.22 
 
 
575 aa  71.2  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1576  hypothetical protein  23.3 
 
 
575 aa  62  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1730  hypothetical protein  24.55 
 
 
509 aa  61.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4575  hypothetical protein  17.94 
 
 
591 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000245831  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1466  ATPase  21.82 
 
 
551 aa  48.5  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0353535  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4364  hypothetical protein  22.18 
 
 
570 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>