15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0996 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0996  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1174    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0594  hypothetical protein  52.06 
 
 
580 aa  553  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.179265  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0718  hypothetical protein  45.44 
 
 
578 aa  504  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2217  hypothetical protein  35.74 
 
 
587 aa  372  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00749141  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4455  hypothetical protein  34.99 
 
 
573 aa  348  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.169873  hitchhiker  0.00310728 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0377  hypothetical protein  34.48 
 
 
573 aa  345  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.133531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1048  hypothetical protein  23.62 
 
 
613 aa  110  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242221  hitchhiker  0.000104388 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0120  hypothetical protein  24.51 
 
 
598 aa  83.6  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.321419  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0137  hypothetical protein  25.93 
 
 
575 aa  74.7  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4575  hypothetical protein  20.75 
 
 
591 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000245831  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0956  Protein of unknown function DUF2326  21.14 
 
 
596 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.178488  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1576  hypothetical protein  21.97 
 
 
575 aa  53.9  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1730  hypothetical protein  22.33 
 
 
509 aa  53.9  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0073  hypothetical protein  18.61 
 
 
576 aa  48.9  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1466  ATPase  20.5 
 
 
551 aa  44.7  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0353535  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>