12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1576 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1576  hypothetical protein  100 
 
 		 575 aa  1174    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4364  hypothetical protein  48.69 
 
 		 570 aa  563  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0073  hypothetical protein  50.09 
 
 		 576 aa  556  1e-157  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3156  hypothetical protein  49.3 
 
 		 575 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00485551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0790  hypothetical protein  36.24 
 
 		 572 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.899701  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2215  hypothetical protein  23.18 
 
 		 564 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.390814 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0718  hypothetical protein  24.13 
 
 		 578 aa  72  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2217  hypothetical protein  22.93 
 
 		 587 aa  71.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00749141  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0377  hypothetical protein  21.15 
 
 		 573 aa  57.8  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.133531  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4455  hypothetical protein  21.25 
 
 		 573 aa  52.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.169873  hitchhiker  0.00310728 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0594  hypothetical protein  22.98 
 
 		 580 aa  50.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.179265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0996  hypothetical protein  21.97 
 
 		 579 aa  43.5  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>