13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4455 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0377  hypothetical protein  85.69 
 
 		 573 aa  1024    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.133531  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4455  hypothetical protein  100 
 
 		 573 aa  1168    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.169873  hitchhiker  0.00310728 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2217  hypothetical protein  48.22 
 
 		 587 aa  528  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00749141  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0996  hypothetical protein  34.99 
 
 		 579 aa  339  9e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0594  hypothetical protein  33.85 
 
 		 580 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.179265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0718  hypothetical protein  32.02 
 
 		 578 aa  303  7.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1048  hypothetical protein  23.98 
 
 		 613 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242221  hitchhiker  0.000104388 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0120  hypothetical protein  21.75 
 
 		 598 aa  83.2  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.321419  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0137  hypothetical protein  22.01 
 
 		 575 aa  72.8  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2215  hypothetical protein  22.89 
 
 		 564 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.390814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1576  hypothetical protein  21.25 
 
 		 575 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4575  hypothetical protein  18.92 
 
 		 591 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000245831  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1730  hypothetical protein  22.22 
 
 		 509 aa  44.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>