12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1048 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1048  hypothetical protein  100 
 
 		 613 aa  1264    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242221  hitchhiker  0.000104388 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0718  hypothetical protein  25.57 
 
 		 578 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2217  hypothetical protein  26.82 
 
 		 587 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00749141  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0594  hypothetical protein  26.8 
 
 		 580 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.179265  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0377  hypothetical protein  23.8 
 
 		 573 aa  109  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.133531  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0996  hypothetical protein  23.62 
 
 		 579 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4455  hypothetical protein  23.98 
 
 		 573 aa  102  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.169873  hitchhiker  0.00310728 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0790  hypothetical protein  22.08 
 
 		 572 aa  52.4  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.899701  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0073  hypothetical protein  42.86 
 
 		 576 aa  47.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3156  hypothetical protein  43.1 
 
 		 575 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00485551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0956  Protein of unknown function DUF2326  23.19 
 
 		 596 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.178488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1466  ATPase  24.26 
 
 		 551 aa  44.3  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0353535  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>